Análisis metatranscriptómico y metagenómico de la diversidad biológica en el lago subglacial Vostok (Antártida)
Autores: Gura, Colby; Rogers, Scott O.
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2020
Acceso abierto
Artículo científico
2020
Análisis metatranscriptómico y metagenómico de la diversidad biológica en el lago subglacial Vostok (Antártida)
Categoría
Ciencias Naturales y Subdisciplinas
Subcategoría
Biología
Palabras clave
Metatranscriptómica
Metagenómica
Antártida
Núcleo de hielo de Vostok
Organismos
Ensenada
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 41
Citaciones: Sin citaciones
Un estudio combinado de metatranscriptómica y metagenómica de secciones del núcleo de hielo de Vostok (Antártida) de hielo glacial, basal y de acumulación de agua de lago arrojó secuencias que indicaban una amplia variedad de especies y posibles condiciones en la base del glaciar y en el lago subglacial Vostok. Pocos organismos eran comunes entre las muestras de hielo basal y de acumulación, lo que sugiere una escasa transmisión de organismos viables desde el agua de deshielo del hielo basal hacia el agua del lago. Además, las muestras de hielo de acumulación, cada una de las cuales se originó en agua de varios lugares de la ensenada poco profunda, exhiben solo pequeñas cantidades de mezcla de especies. La porción más occidental de la ensenada tenía muy bajos números de organismos, probablemente debido a condiciones biológicamente desafiantes. Se encontraron números crecientes de organismos al avanzar de oeste a este, hasta aproximadamente 7 km dentro de la ensenada. En ese punto, los números de secuencias únicas y lecturas de secuencias de organismos termofílicos, termotolerantes, psicrofílicos y psicrotolerantes aumentaron drásticamente, al igual que las secuencias de organismos alcalifílicos, alcalitolerantes, acidofílicos y acidotolerantes. El número de secuencias únicas y totales se asoció positivamente con aumentos en las concentraciones de Na, Ca, Mg, SO, Cl, aminoácidos totales y carbono orgánico no purgable. Los números de secuencias únicas de organismos reportados de fuentes de suelo, sedimento, hielo, acuáticas, marinas, animales y plantas (probablemente polen) también alcanzaron su punto máximo en esta región, lo que sugiere que esta fue la región más biológicamente activa. La confluencia de los altos números de organismos, fisiologías y capacidades metabólicas sugiere la presencia de fuentes de energía y nutrientes en la mitad oriental de la ensenada. Los datos de la cuenca principal sugirieron un ambiente oligotrófico frío que contenía menos organismos. Además de las bacterias, tanto el hielo basal como el hielo de acumulación contenían secuencias de un ensamblaje diverso de eucariotas, así como de bacterias que se sabe que están asociadas con eucariotas multicelulares.
Descripción
Un estudio combinado de metatranscriptómica y metagenómica de secciones del núcleo de hielo de Vostok (Antártida) de hielo glacial, basal y de acumulación de agua de lago arrojó secuencias que indicaban una amplia variedad de especies y posibles condiciones en la base del glaciar y en el lago subglacial Vostok. Pocos organismos eran comunes entre las muestras de hielo basal y de acumulación, lo que sugiere una escasa transmisión de organismos viables desde el agua de deshielo del hielo basal hacia el agua del lago. Además, las muestras de hielo de acumulación, cada una de las cuales se originó en agua de varios lugares de la ensenada poco profunda, exhiben solo pequeñas cantidades de mezcla de especies. La porción más occidental de la ensenada tenía muy bajos números de organismos, probablemente debido a condiciones biológicamente desafiantes. Se encontraron números crecientes de organismos al avanzar de oeste a este, hasta aproximadamente 7 km dentro de la ensenada. En ese punto, los números de secuencias únicas y lecturas de secuencias de organismos termofílicos, termotolerantes, psicrofílicos y psicrotolerantes aumentaron drásticamente, al igual que las secuencias de organismos alcalifílicos, alcalitolerantes, acidofílicos y acidotolerantes. El número de secuencias únicas y totales se asoció positivamente con aumentos en las concentraciones de Na, Ca, Mg, SO, Cl, aminoácidos totales y carbono orgánico no purgable. Los números de secuencias únicas de organismos reportados de fuentes de suelo, sedimento, hielo, acuáticas, marinas, animales y plantas (probablemente polen) también alcanzaron su punto máximo en esta región, lo que sugiere que esta fue la región más biológicamente activa. La confluencia de los altos números de organismos, fisiologías y capacidades metabólicas sugiere la presencia de fuentes de energía y nutrientes en la mitad oriental de la ensenada. Los datos de la cuenca principal sugirieron un ambiente oligotrófico frío que contenía menos organismos. Además de las bacterias, tanto el hielo basal como el hielo de acumulación contenían secuencias de un ensamblaje diverso de eucariotas, así como de bacterias que se sabe que están asociadas con eucariotas multicelulares.