A pesar de la creciente evidencia sobre los patrones de movimiento adaptativos que los caballos adoptan durante el ejercicio en una caminadora acuática (WT), las adaptaciones subyacentes en la actividad muscular siguen sin investigarse. Este estudio de viabilidad tuvo como objetivo desarrollar un método para la medición sincrónica de la actividad muscular y el movimiento de los caballos durante el ejercicio en WT. Se recopilaron datos combinados de electromiografía de superficie (sEMG) (2000 Hz) de músculos seleccionados de las extremidades traseras (bíceps femoral, glúteo medio, tensor de la fascia lata) y epaxiales (longísimo del dorso), así como datos cinemáticos tridimensionales (200 Hz) de la espalda y la pelvis de un (n = 1) caballo durante condiciones de caminata en terreno (OG), caminadora seca (TM) y caminadora acuática (WT). El mapeo paramétrico estadístico evaluó las diferencias en la sEMG normalizada por tiempo y amplitud, así como las formas de onda cinemáticas toracolumbares y de la pelvis entre las condiciones. Se observaron adaptaciones distintas y significativas (< 0.05) en los patrones de activación muscular de las extremidades traseras y epaxiales, así como en la cinemática axial y pélvica, en este caballo a través de las condiciones de ejercicio. La actividad muscular adaptativa fue más pronunciada en este caballo durante WT, en comparación con la caminata OG. Estos hallazgos demuestran la viabilidad de este método, que combina tecnologías de sEMG y captura de movimiento para cuantificar sincrónicamente el movimiento equino y los patrones de activación muscular durante el ejercicio en WT. Esto justifica la replicación de este trabajo en una muestra más grande de caballos para informar programas de entrenamiento y rehabilitación basados en evidencia.