La era actual presencia un avance notable en la utilización de biomasa, guiado por los principios de la química verde y la biorefinería, así como por la explotación integral de materias primas de origen vegetal. Predominantemente, se han perseguido métodos de producción a gran escala, similares a los enfoques de la industria del petróleo, lo que permite la incorporación de nuevos productos en los mercados de energía y petroquímica. Sin embargo, la viabilidad de tales sistemas a pequeña y mediana escala se ve obstaculizada por desafíos logísticos y las limitaciones de las economías de escala. Para los pequeños productores agrícolas y las empresas de procesamiento de alimentos, la utilización completa de la biomasa trasciende la responsabilidad ambiental, evolucionando hacia una estrategia de supervivencia a través de la diversificación de subproductos con mayor valor. El estado de Río de Janeiro en Brasil presenta una variedad de dinámicas poblacionales, características geográficas, condiciones climáticas y patrones de producción agrícola que se asemejan estrechamente a los que se encuentran en varios países tropicales y regiones agrícolas de todo el mundo. Esta región, que sostiene un cinturón verde que apoya a 17 millones de personas, proporciona un caso de estudio adecuado para investigar compuestos químicos con valor potencial entre los residuos agroindustriales, lo que puede motivar la creación de una industria biotecnológica lucrativa. Ejemplos incluyen naringenina y hesperidina de naranjas y limones, epi-gallo-catequina galato de plátanos, ácidos cafeicos de café y la enzima bromelina de piñas. Este estudio aborda los desafíos asociados con el desarrollo de alternativas biotecnológicas dentro de la agroindustria, considerando aspectos económicos, tecnológicos, logísticos y relacionados con el mercado. Las ideas obtenidas al examinar el estado brasileño de Río de Janeiro contribuirán al discurso más amplio sobre la utilización sostenible de la biomasa y la creación de subproductos de valor agregado.