El pato Huitang (HT), una raza local de élite de larga domesticación de la provincia de Hunan, China, con excelente calidad de carne, no ha tenido su estructura genética poblacional y los barridos selectivos genómicos estudiados extensamente hasta la fecha. Este estudio midió las características fenotípicas de HT y realizó un análisis comparativo entre HT y 16 razas diferentes de patos, incluyendo razas salvajes, indígenas y de carne, para caracterizar su estructura poblacional y potencial genético. Los resultados revelaron que HT es una raza indígena de doble propósito con un fondo genético estrechamente relacionado con el pato sheldrake de Youxian y los patos de Linwu. En el análisis de barrido selectivo entre HT y los patos de Linwu, se identificaron genes como , y , que están asociados con el crecimiento y desarrollo muscular, cerca de las 27 señales de selección. La comparación entre HT y los patos Jinding reveló 68 señales selectivas que contenían genes importantes asociados con el desarrollo ovárico (, , y ) y comportamientos de puesta de huevos (). El análisis de barrido selectivo entre HT y los patos sheldrake de Youxian encontró 93 regiones selectivas que cubren genes relacionados tanto con la carne ( y ) como con la producción de huevos ( y ). Nuestro estudio puede proporcionar un nuevo conocimiento para explorar la estructura poblacional y el potencial genético de HT, ofreciendo una base teórica para sus estrategias de cría en el futuro.