Perspectivas sobre el Fondo Genómico de Nueve Plantas Medicinales Chinas Comunes mediante Citometría de Flujo y Encuesta Genómica
Autores: An, Chang; Li, Denglin; Lu, Lin; Liu, Chaojia; Xu, Xiaowen; Xie, Shiyu; Wang, Jing; Liu, Ruoyu; Yang, Chengzi; Qin, Yuan; Zheng, Ping
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Perspectivas sobre el Fondo Genómico de Nueve Plantas Medicinales Chinas Comunes mediante Citometría de Flujo y Encuesta Genómica
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Plantas medicinales
Tamaños de genoma
Encuestas genómicas
Poliploidia
Genómica poblacional
Desarrollo sostenible
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 7
Citaciones: Sin citaciones
Las plantas medicinales han desempeñado un papel crucial en los sistemas de salud durante mucho tiempo, pero la información genómica limitada sobre estas especies ha impedido la integración de tecnologías biológicas modernas en la investigación de plantas medicinales. En este estudio, seleccionamos nueve plantas medicinales comunes, cada una perteneciente a una familia de plantas diferente, incluyendo (Chloranthaceae), (Vitaceae), (Fabaceae), (Cucurbitaceae), (Polygonaceae), (Caryophyllaceae), (Rubiaceae), (Lamiaceae) y (Asteraceae), para estimar sus tamaños de genoma y realizar encuestas genómicas preliminares. Los tamaños de genoma estimados por citometría de flujo fueron 3.66 Gb, 0.65 Gb, 0.58 Gb, 1.02 Gb, 3.96 Gb, 2.99 Gb, 0.43 Gb, 0.78 Gb y 7.27 Gb, respectivamente. Los tamaños de genoma de , , y han sido reportados previamente. Los análisis comparativos sugieren que las variaciones en el tamaño del genoma pueden surgir debido a diferencias en los métodos de medición y las fuentes de muestra. Por lo tanto, es necesario emplear múltiples enfoques para evaluar el tamaño del genoma y proporcionar información más confiable para futuras investigaciones genómicas. Basado en la encuesta genómica, especies con variación considerable en el tamaño del genoma o poliploidia, como , deberían someterse a un análisis de ploidía junto con estudios de genómica poblacional para elucidar el desarrollo del tamaño de genoma diversificado. Además, una encuesta genómica de , una planta medicinal con un tamaño de genoma relativamente pequeño (509.08 Mb) y de considerable interés en el sur de China, reveló una baja tasa de heterocigosidad (0.382%) y un contenido de repeticiones moderado (51.24%). Dado los costos de investigación limitados, esta especie representa un candidato adecuado para futuros estudios genómicos sobre plantas medicinales leguminosas características del sur de China. Esta información genómica fundamental servirá como una referencia crítica para el desarrollo sostenible y la utilización de estas plantas medicinales.
Descripción
Las plantas medicinales han desempeñado un papel crucial en los sistemas de salud durante mucho tiempo, pero la información genómica limitada sobre estas especies ha impedido la integración de tecnologías biológicas modernas en la investigación de plantas medicinales. En este estudio, seleccionamos nueve plantas medicinales comunes, cada una perteneciente a una familia de plantas diferente, incluyendo (Chloranthaceae), (Vitaceae), (Fabaceae), (Cucurbitaceae), (Polygonaceae), (Caryophyllaceae), (Rubiaceae), (Lamiaceae) y (Asteraceae), para estimar sus tamaños de genoma y realizar encuestas genómicas preliminares. Los tamaños de genoma estimados por citometría de flujo fueron 3.66 Gb, 0.65 Gb, 0.58 Gb, 1.02 Gb, 3.96 Gb, 2.99 Gb, 0.43 Gb, 0.78 Gb y 7.27 Gb, respectivamente. Los tamaños de genoma de , , y han sido reportados previamente. Los análisis comparativos sugieren que las variaciones en el tamaño del genoma pueden surgir debido a diferencias en los métodos de medición y las fuentes de muestra. Por lo tanto, es necesario emplear múltiples enfoques para evaluar el tamaño del genoma y proporcionar información más confiable para futuras investigaciones genómicas. Basado en la encuesta genómica, especies con variación considerable en el tamaño del genoma o poliploidia, como , deberían someterse a un análisis de ploidía junto con estudios de genómica poblacional para elucidar el desarrollo del tamaño de genoma diversificado. Además, una encuesta genómica de , una planta medicinal con un tamaño de genoma relativamente pequeño (509.08 Mb) y de considerable interés en el sur de China, reveló una baja tasa de heterocigosidad (0.382%) y un contenido de repeticiones moderado (51.24%). Dado los costos de investigación limitados, esta especie representa un candidato adecuado para futuros estudios genómicos sobre plantas medicinales leguminosas características del sur de China. Esta información genómica fundamental servirá como una referencia crítica para el desarrollo sostenible y la utilización de estas plantas medicinales.