El Mitogenoma de (Crassulaceae): Perspectivas sobre la Edición de ARN, Transferencia Horizontal de Genes y Implicaciones Filogenéticas
Autores: Ding, Hengwu; Bi, De; Zhang, Sijia; Han, Shiyun; Ye, Yuanxin; Yi, Ran; Yang, Jianke; Liu, Birong; Wu, Longhua; Zhuo, Renying; Kan, Xianzhao
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2022
Acceso abierto
Artículo científico
2022
El Mitogenoma de (Crassulaceae): Perspectivas sobre la Edición de ARN, Transferencia Horizontal de Genes y Implicaciones Filogenéticas
Categoría
Ciencias Naturales y Subdisciplinas
Subcategoría
Biología
Palabras clave
La familia más grande
Orden Saxifragales
Crassulaceae
Mitogenoma
Edición de ARN
Evolución de las plantas
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 13
Citaciones: Sin citaciones
Como la familia más grande dentro del orden Saxifragales, Crassulaceae contiene alrededor de 34 géneros con 1400 especies. Las mitocondrias desempeñan un papel crítico en la producción de energía celular. Desde que se informó del primer mitogenoma de una planta terrestre, se han depositado más de 400 secuencias mitogenómicas en una base de datos pública. Sin embargo, hasta la fecha, no se han disponible datos de mitogenomas completos para especies de Crassulaceae. Para comprender mejor la historia evolutiva de los orgánulos de Crassulaceae, secuenciamos y realizamos análisis exhaustivos sobre el mitogenoma de . El círculo mitogenómico maestro tiene una longitud de 212,159 pb, incluyendo 31 genes que codifican proteínas (PCGs), 14 genes de tRNA y 3 genes de rRNA. Además, identificamos un total de 508 sitios de edición de RNA en los PCGs y demostramos que las posiciones del segundo codón de los genes mitocondriales son las más propensas a eventos de edición de RNA. Notablemente, mediante análisis de gráficos de neutralidad, observamos que los eventos de edición de RNA mitocondrial tienen grandes efectos sobre las fuerzas impulsoras de la evolución de las plantas. Adicionalmente, se detectaron 4 MTPTs y 686 NUMTs en los genomas mitocondriales y nucleares de , respectivamente. Además, realizamos análisis adicionales sobre la transferencia de genes, las estructuras secundarias de los RNAs mitocondriales y las implicaciones filogenéticas. Por lo tanto, los hallazgos presentados aquí serán útiles para futuras investigaciones sobre mitogenomas de plantas.
Descripción
Como la familia más grande dentro del orden Saxifragales, Crassulaceae contiene alrededor de 34 géneros con 1400 especies. Las mitocondrias desempeñan un papel crítico en la producción de energía celular. Desde que se informó del primer mitogenoma de una planta terrestre, se han depositado más de 400 secuencias mitogenómicas en una base de datos pública. Sin embargo, hasta la fecha, no se han disponible datos de mitogenomas completos para especies de Crassulaceae. Para comprender mejor la historia evolutiva de los orgánulos de Crassulaceae, secuenciamos y realizamos análisis exhaustivos sobre el mitogenoma de . El círculo mitogenómico maestro tiene una longitud de 212,159 pb, incluyendo 31 genes que codifican proteínas (PCGs), 14 genes de tRNA y 3 genes de rRNA. Además, identificamos un total de 508 sitios de edición de RNA en los PCGs y demostramos que las posiciones del segundo codón de los genes mitocondriales son las más propensas a eventos de edición de RNA. Notablemente, mediante análisis de gráficos de neutralidad, observamos que los eventos de edición de RNA mitocondrial tienen grandes efectos sobre las fuerzas impulsoras de la evolución de las plantas. Adicionalmente, se detectaron 4 MTPTs y 686 NUMTs en los genomas mitocondriales y nucleares de , respectivamente. Además, realizamos análisis adicionales sobre la transferencia de genes, las estructuras secundarias de los RNAs mitocondriales y las implicaciones filogenéticas. Por lo tanto, los hallazgos presentados aquí serán útiles para futuras investigaciones sobre mitogenomas de plantas.