Se investiga la inestabilidad de los vórtices lenticulares superficiales utilizando un conjunto integral de experimentos de laboratorio combinados con análisis de estabilidad lineal numérica, así como simulaciones numéricas no lineales en un modelo de Agua Poco Profunda Rotacional de dos capas. Se discute el desarrollo de inestabilidades y se compara entre los diferentes métodos. El análisis de estabilidad lineal permite una descripción clara del origen de la inestabilidad observada tanto en los experimentos de laboratorio como en las simulaciones numéricas. Si bien se encuentra un acuerdo cualitativo global, se observan y discuten algunas discrepancias. Nuestro estudio destaca que la sensibilidad del resultado de la inestabilidad está relacionada con la condición inicial y el flujo de la capa inferior. La inhibición o incluso supresión de algunos modos inestables puede explicarse en términos del perfil de vorticidad potencial de la capa inferior.