La tolerancia a la sequía de los cultivos puede mejorar genéticamente mediante el establecimiento de ideotipos de plantas con respuestas de rendimiento mejoradas asociadas con rasgos agronómicos y marcadores bioquímicos. El objetivo de este estudio fue comparar 20 accesiones de L. cultivadas bajo dos tratamientos de agua diferentes (100% y 35% de reintegración de evapotranspiración por riego) para seleccionar genotipos tolerantes potenciales para el cultivo orgánico basados en varios parámetros agronómicos y bioquímicos medidos en respuesta al estrés por sequía. Se registraron diferencias significativas para el genotipo y el régimen de riego y para su interacción (<0.0001 ***). Se realizó un análisis de componentes principales para resumir las correlaciones entre los fitoquímicos analizados y los genotipos estresados y no estresados, destacando la importancia de los compuestos antioxidantes como biomarcadores de estrés. Los resultados actuales mostraron que la sequía reduce significativamente los parámetros de crecimiento y aumenta la cantidad de ácido ascórbico y polifenoles en comparación con el control irrigado. Además, los resultados muestran que el metabolismo antioxidante aumentó por la sequía en algunos genotipos, mientras que otros mantuvieron una buena producción de biomasa al aumentar el valor de los parámetros de crecimiento considerados. Basándose en la suma promedio de rangos (ASR) de parámetros morfo-fisiológicos y bioquímicos, se determinó que los genotipos CR, CC y BH fueron los más tolerantes a la sequía, mientras que CI5, BU y CV1 fueron los más susceptibles. Debido al potencial de estos genotipos, se llevará a cabo una investigación molecular y celular adicional para identificar el marcador genético asociado con la respuesta al estrés hídrico.