El volcanismo es la expresión más extendida de procesos cíclicos de formación y/o destrucción que moldean la superficie de la Tierra. Las calderas son depresiones morfológicas resultantes del colapso de una cámara magmática tras grandes erupciones y se encuentran comúnmente en regímenes tectono-magmáticos relacionados con la subducción, como en entornos de arco y retroarco. Algunos de los ejemplos más impresionantes de emisión hidrotermal en el fondo marino ocurren dentro de calderas submarinas. Aquí, mostramos los resultados de investigaciones magnéticas en dos calderas submarinas hidrotermalmente activas, es decir, el monte submarino Palinuro en el mar Tirreno meridional, Italia, y el volcán Brothers del arco Kermadec, Nueva Zelanda. Estos volcanes se encuentran en diferentes entornos geodinámicos pero muestran similitudes en el desarrollo de sus sistemas hidrotermales, ambos alojados dentro de calderas. Presentamos un nuevo modelo integrado basado en datos morfológicos, geológicos y magnéticos para la caldera de Palinuro, y lo comparamos con el modelo bien establecido de la caldera de Brothers, destacando las diferencias y características comunes en las expresiones geofísicas de ambos sistemas hidrotermales. Para ser consistentes con los resultados en el volcán Brothers, construimos un modelo de áreas desmagnetizadas asociadas con alteración hidrotermal derivada de la inversión 3D de datos magnéticos. Ambos modelos para Brothers y Palinuro muestran que las zonas de flujo ascendente hidrotermal están fuertemente controladas por las estructuras de la caldera, que proporcionan caminos de permeabilidad a gran escala, favoreciendo la circulación de los fluidos hidrotermales a profundidad.