Aunque el acolchado es una práctica agronómica ampliamente utilizada, sus efectos en la rizosfera siguen siendo poco comprendidos. Aquí, empleamos secuenciación de amplicones y transcriptómica para investigar variaciones en un sistema de rizosfera de vid bajo tratamiento de acolchado (paja de arroz + fieltro + película plástica). Analizando secuencias de ARNr 16S y espaciador intergénico (ITS) indicaron que los índices de Shannon y Simpson de las comunidades bacterianas y fúngicas aumentaron notablemente bajo el tratamiento de acolchado. Las composiciones bacterianas y fúngicas variaron significativamente entre el control y los tratamientos de acolchado. El acolchado enriqueció microbios potencialmente beneficiosos que confieren resistencia a enfermedades a las plantas o participan en el metabolismo del nitrógeno, mientras que se detectaron más microbios potencialmente patógenos en el control. Además, ciertas bacterias y hongos mostraron diferentes correlaciones con las funciones del transcriptoma de raíz del módulo MEBlue. La complejidad de las redes de co-ocurrencia bacteriana y fúngica aumentó con un mayor número de nodos, enlaces positivos y negativos después del acolchado. Después del acolchado, la rizosfera mostró un pH elevado, materia orgánica y actividades de catalasa aumentadas, y actividades de sucrasa y celulasa y beta-glucosidasa disminuidas. Nuestros resultados proporcionan datos completos que muestran cómo un sistema de rizosfera de vid respondió al tratamiento de acolchado y arrojaron información importante sobre las prácticas de acolchado para árboles frutales.