Análisis transcriptómico comparativo de la respuesta al estrés por baja salinidad en el cangrejo nadador
Autores: Sun, Dongfang; Lv, Jianjian; Li, Yukun; Wu, Jie; Liu, Ping; Gao, Baoquan
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Análisis transcriptómico comparativo de la respuesta al estrés por baja salinidad en el cangrejo nadador
Categoría
Ciencias Naturales y Subdisciplinas
Subcategoría
Biología
Palabras clave
Bacterias patógenas
Mortalidad masiva
Acuicultura
Estimulación de baja salinidad
Infecciones
Análisis transcriptómico
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 17
Citaciones: Sin citaciones
es una de las principales bacterias patógenas y causa mortalidad masiva en la acuicultura. Además, la estimulación de baja salinidad hace que sea más susceptible a infecciones. Con el fin de elucidar el mecanismo molecular de resistencia a en , se llevó a cabo un análisis transcriptómico comparativo de células sanguíneas estimuladas por baja salinidad en este estudio. La secuenciación del transcriptoma del estrés por baja salinidad y la infección por patógenos en diferentes puntos temporales se completó utilizando tecnología de secuenciación Illumina. Se encontraron un total de 5827, 6432, 5362 y 1784 genes expresados diferencialmente (DEGs) involucrados en vías relacionadas con el transporte de iones y la inmunorregulación bajo estrés por baja salinidad a las 12, 24, 48 y 72 h en comparación con el control a 0 h. En contraste, se encontraron 4854, 4814, 5535 y 6051 DEGs, que estaban significativamente enriquecidos en las vías de señalización Toll e IMD, a las 12, 24, 48 y 72 h en comparación con el control a 0 h bajo infección. Entre ellos, 952 DEGs fueron compartidos en los dos grupos de tratamiento, que estaban principalmente involucrados en la apoptosis y la vía de señalización Hippo. El análisis de clúster seleccionó 103 genes que se expresaron diferencialmente en dos factores que estaban negativamente correlacionados, incluyendo inmunoglobulina, familia de receptores de leucocitos, receptor de eliminador, macroglobulina y otros genes relacionados con la inmunidad innata. Estos resultados proporcionan apoyo de datos para el análisis de los mecanismos de inmunidad bajo estrés por baja salinidad en y ayudan a elucidar los mecanismos moleculares por los cuales los factores ambientales afectan la inmunidad.
Descripción
es una de las principales bacterias patógenas y causa mortalidad masiva en la acuicultura. Además, la estimulación de baja salinidad hace que sea más susceptible a infecciones. Con el fin de elucidar el mecanismo molecular de resistencia a en , se llevó a cabo un análisis transcriptómico comparativo de células sanguíneas estimuladas por baja salinidad en este estudio. La secuenciación del transcriptoma del estrés por baja salinidad y la infección por patógenos en diferentes puntos temporales se completó utilizando tecnología de secuenciación Illumina. Se encontraron un total de 5827, 6432, 5362 y 1784 genes expresados diferencialmente (DEGs) involucrados en vías relacionadas con el transporte de iones y la inmunorregulación bajo estrés por baja salinidad a las 12, 24, 48 y 72 h en comparación con el control a 0 h. En contraste, se encontraron 4854, 4814, 5535 y 6051 DEGs, que estaban significativamente enriquecidos en las vías de señalización Toll e IMD, a las 12, 24, 48 y 72 h en comparación con el control a 0 h bajo infección. Entre ellos, 952 DEGs fueron compartidos en los dos grupos de tratamiento, que estaban principalmente involucrados en la apoptosis y la vía de señalización Hippo. El análisis de clúster seleccionó 103 genes que se expresaron diferencialmente en dos factores que estaban negativamente correlacionados, incluyendo inmunoglobulina, familia de receptores de leucocitos, receptor de eliminador, macroglobulina y otros genes relacionados con la inmunidad innata. Estos resultados proporcionan apoyo de datos para el análisis de los mecanismos de inmunidad bajo estrés por baja salinidad en y ayudan a elucidar los mecanismos moleculares por los cuales los factores ambientales afectan la inmunidad.