Se considera sistemáticamente una ecuación generalizada de Yu-Toda-Sasa-Fukuyama en (3+1) dimensiones. Se obtienen soluciones solitónicas utilizando el método bilineal de Hirota. El empleo de la condición de conjugado complejo de parámetros de las soluciones solitónicas conduce a la construcción de soluciones de respiración. Luego, se obtiene la solución en forma de montón con la ayuda del método del límite de onda larga. Basándose en el mecanismo de transformación de ondas no lineales, una serie de ondas localizadas no lineales pueden transformarse a partir de respiradores, que incluyen el solitón cuasi-kink, el solitón kink en forma de M, el solitón kink en forma de M de oscilación, el solitón kink de múltiples picos y la onda cuasi-periódica mediante el análisis de las líneas características. Además, se estudia el estado molecular del dos-respirador transformado utilizando la resonancia de velocidad, que se divide en tres aspectos, a saber, los modos de transformación no, semi- y completa. El método analítico discutido en este documento puede aplicarse además a la investigación de otros sistemas integrables no lineales complejos de alta dimensión.