Disección de la resistencia al óxido común en una población multiparental de maíz tropical a través de estudios de GWAS y estudios de ligadura
Autores: Li, Linzhuo; Jiang, Fuyan; Bi, Yaqi; Yin, Xingfu; Zhang, Yudong; Li, Shaoxiong; Zhang, Xingjie; Liu, Meichen; Li, Jinfeng; Shaw, Ranjan K.; Ijaz, Babar; Fan, Xingming
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Disección de la resistencia al óxido común en una población multiparental de maíz tropical a través de estudios de GWAS y estudios de ligadura
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
óxido
Maíz
Resistencia
Arquitectura genética
Genes candidatos
QTLs
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 10
Citaciones: Sin citaciones
El óxido común (CR), causado por, es una enfermedad foliar importante en el maíz que conduce a la deterioración de la calidad y pérdidas en el rendimiento. Para desentrañar la arquitectura genética de la resistencia al CR en el maíz, este estudio utilizó la línea inbred temperada susceptible Ye107 como el padre masculino cruzado con tres líneas inbred de maíz tropical resistentes (CML312, D39 y Y32) para generar 627 líneas recombinantes inbred (RILs), con el objetivo de identificar loci resistentes a enfermedades en el maíz y genes candidatos para el óxido común. Los datos fenotípicos mostraron una buena segregación entre resistencia y susceptibilidad, con diferentes grados de resistencia observados en diferentes subpoblaciones. Se observaron efectos significativos del genotipo y interacciones genotipo x ambiente, con una heredabilidad que varió del 85.7% al 92.2%. Los análisis de ligamiento y asociación a nivel del genoma en los tres ambientes identificaron 20 QTLs y 62 SNPs significativos. Entre estos, siete QTLs principales explicaron el 66% de la varianza fenotípica. La comparación con seis SNPs identificados repetidamente en diferentes ambientes reveló superposición entre y, y. El análisis de haplotipos indicó dos haplotipos diferentes para la resistencia al CR para ambos SNPs. Basado en los gráficos de decaimiento de LD, se identificaron tres genes candidatos co-localizados, y, y, dentro de 20 kb aguas arriba y aguas abajo de estos dos SNPs. regula la regulación hormonal, controla la apertura y cierre estomático, está relacionado con los tricomas y está asociado con las respuestas inmunitarias de las plantas a enfermedades. Además, realizamos un cribado de genes candidatos para cinco SNPs adicionales que fueron detectados repetidamente en diferentes ambientes, lo que resultó en la identificación de cinco genes candidatos. Estos hallazgos contribuyen al desarrollo de recursos genéticos para la resistencia al óxido común en los programas de mejoramiento del maíz.
Descripción
El óxido común (CR), causado por, es una enfermedad foliar importante en el maíz que conduce a la deterioración de la calidad y pérdidas en el rendimiento. Para desentrañar la arquitectura genética de la resistencia al CR en el maíz, este estudio utilizó la línea inbred temperada susceptible Ye107 como el padre masculino cruzado con tres líneas inbred de maíz tropical resistentes (CML312, D39 y Y32) para generar 627 líneas recombinantes inbred (RILs), con el objetivo de identificar loci resistentes a enfermedades en el maíz y genes candidatos para el óxido común. Los datos fenotípicos mostraron una buena segregación entre resistencia y susceptibilidad, con diferentes grados de resistencia observados en diferentes subpoblaciones. Se observaron efectos significativos del genotipo y interacciones genotipo x ambiente, con una heredabilidad que varió del 85.7% al 92.2%. Los análisis de ligamiento y asociación a nivel del genoma en los tres ambientes identificaron 20 QTLs y 62 SNPs significativos. Entre estos, siete QTLs principales explicaron el 66% de la varianza fenotípica. La comparación con seis SNPs identificados repetidamente en diferentes ambientes reveló superposición entre y, y. El análisis de haplotipos indicó dos haplotipos diferentes para la resistencia al CR para ambos SNPs. Basado en los gráficos de decaimiento de LD, se identificaron tres genes candidatos co-localizados, y, y, dentro de 20 kb aguas arriba y aguas abajo de estos dos SNPs. regula la regulación hormonal, controla la apertura y cierre estomático, está relacionado con los tricomas y está asociado con las respuestas inmunitarias de las plantas a enfermedades. Además, realizamos un cribado de genes candidatos para cinco SNPs adicionales que fueron detectados repetidamente en diferentes ambientes, lo que resultó en la identificación de cinco genes candidatos. Estos hallazgos contribuyen al desarrollo de recursos genéticos para la resistencia al óxido común en los programas de mejoramiento del maíz.