El linfoma canino (LC) es uno de los tumores malignos más comunes en los perros. La causa del LC sigue siendo incierta. Las mutaciones genéticas que se han sugerido como posibles causas del LC no se comprenden completamente. La secuenciación del exoma completo (SEC) es un método eficaz en tiempo y costo para detectar variantes genéticas que se dirigen únicamente a las regiones codificadoras de proteínas (exones) que son parte de toda la región del genoma. Se reclutaron un total de ocho pacientes con linfomas de células B, y se realizó un análisis de SEC en muestras de sangre total y aspirados de ganglios linfáticos de cada paciente. Se identificaron un total de 17 variantes somáticas con un impacto moderado a alto mediante el análisis de SEC. A través de un análisis de vías de la Enciclopedia de Genes y Genomas de Kyoto (KEGG) de 17 genes con mutaciones somáticas, se identificaron un total de 16 vías. En general, las mutaciones somáticas identificadas en este estudio sugieren nuevas mutaciones candidatas para el LC, y se necesitan más estudios para confirmar el papel de estas mutaciones.