Este estudio, realizado en Polonia, comparó la microbiota intestinal de los ciervos de cola blanca y los ciervos rojos. Se recolectaron muestras de los intestinos delgados y gruesos de seis individuos de ambas especies durante la temporada de caza. Los análisis microbiológicos revelaron variaciones entre especies en la composición y abundancia de microorganismos, aunque las diferencias observadas no fueron estadísticamente significativas. Los ciervos rojos tenían un mayor número de la mayoría de los microorganismos, particularmente, lo que sugiere diferencias en la fisiología gastrointestinal y una dieta alta en fibra. Las dietas de los ciervos de cola blanca son ricas en hierbas, hongos y cereales, lo que contribuye a mayores abundancias de spp. en el intestino grueso. Independientemente de la especie, el intestino grueso tenía una microbiota más rica y diversa que el intestino delgado. Factores estacionales, la edad y el hábitat probablemente influyen en la composición del microbioma. Es importante destacar que no se detectó Salmonella, lo que indica un bajo riesgo de zoonosis en el área de estudio. Estos hallazgos destacan el papel del microbioma en la digestión, la adaptación nutricional y las condiciones ambientales. Comprender estos ecosistemas microbianos es crucial para monitorear la salud de la vida silvestre, evaluar reservorios de patógenos y evaluar los impactos ambientales. Este estudio complementa los datos limitados sobre la microbiota intestinal de los rumiantes nativos polacos, con implicaciones para la conservación de la naturaleza y la microbiología ambiental.