El desarrollo de técnicas de identificación sexual no letales es necesario para apoyar la gestión de reproductores en las almejas geoduck. Se presenta como una especie de acuicultura emergente en Nueva Zelanda y, al igual que otras especies, no se puede determinar con precisión el sexo antes de la desove, lo que complica la producción y el crecimiento poblacional posterior. En este estudio, se utilizó la metabolómica por cromatografía líquida-espectrometría de masas en tándem (LC-MS/MS) para analizar muestras de tejido branquial y muscular de machos y hembras. A partir de los resultados, se identificaron 17 metabolitos que diferían significativamente entre los sexos. Aquí se sugiere la biosíntesis de lípidos en las almejas hembras para apoyar las funciones reproductivas, mientras que las vías de carbohidratos sostienen la producción de esperma en los machos. Esta investigación, por primera vez, proporciona valiosos conocimientos sobre posibles biomarcadores sexuales, presentando la metabolómica como un método de identificación sexual no letal que puede ser utilizado para mejorar las estrategias de reproducción en la acuicultura de geoduck.