Con el desarrollo próspero de la equitación, desentrañar los mecanismos de regulación metabólica en deportes de alta intensidad para caballos se ha convertido en un foco de investigación destinado a mejorar el rendimiento en carreras, optimizar programas de entrenamiento y prevenir lesiones atléticas. En este estudio, recolectamos muestras de sangre de los tres mejores participantes de caballos Yili que participaron en carreras de 5000 m antes y después. Al realizar un análisis de lipidómica y proteómica, identificamos 10 lípidos diferenciales y 79 proteínas diferenciales entre los dos grupos, que se acumularon significativamente en vías relacionadas con la regulación de la lipólisis en adipocitos, el metabolismo de glicerolípidos, el proteasoma y la diabetes mellitus tipo II. Nuestros hallazgos indican que los caballos Yili pueden mantener su energía y equilibrio fisiológico durante la carrera al inhibir la degradación de proteínas y optimizar el metabolismo de lípidos, proporcionando así una base teórica para mejorar el rendimiento en carreras equinas.