Impacto de la temporada en las comunidades bacterianas intestinales y la diversidad patógena en dos especies de patos en cautiverio
Autores: Sakda, Patthanan; Xiang, Xingjia; Song, Zhongqiao; Wu, Yuannuo; Zhou, Lizhi
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Impacto de la temporada en las comunidades bacterianas intestinales y la diversidad patógena en dos especies de patos en cautiverio
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Zootecnia
Palabras clave
Vertebrados
Bacterias intestinales
Composición microbiana
Fluctuación estacional
Secuenciación de alto rendimiento
Bacterias patógenas
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 8
Citaciones: Sin citaciones
Los vertebrados y sus bacterias intestinales interactúan de maneras complejas y mutuamente beneficiosas. La composición microbiana intestinal está influenciada por varias influencias externas. Además de la comida, los elementos abióticos del entorno, como la temperatura, la humedad y la fluctuación estacional, también son determinantes importantes. Se recolectaron muestras fecales de dos especies de patos en cautiverio, el pato de Baikal y el pato común, a lo largo de cuatro estaciones (verano, otoño, invierno y primavera). Estos patos fueron alimentados consistentemente con la misma dieta durante todo el experimento. Se empleó secuenciación de alto rendimiento (Illumina Mi-seq) para analizar la región V4-V5 del gen 16sRNA. Los filos dominantes en todas las estaciones fueron Proteobacteria y Firmicutes. Curiosamente, la diversidad alfa fue mayor en invierno para ambas especies. El análisis NMDS, PCoA y ANOSIM mostró el agrupamiento distinto de la composición bacteriana entre diferentes estaciones, mientras que no se descubrieron diferencias significativas entre las especies de patos dentro de la misma estación. Además, el análisis LefSe demostró biomarcadores específicos en diferentes estaciones, siendo el mayor número revelado en invierno. El análisis de la red de co-ocurrencia también mostró que durante el invierno, la red ilustró una estructura más intrincada con el mayor número de nodos y aristas. Sin embargo, este estudio identificó diez especies bacterianas potencialmente patógenas, que mostraron una diversidad y abundancia significativamente aumentadas durante el verano. En general, nuestros resultados revelaron que la estación reguló principalmente la composición de la comunidad bacteriana intestinal y las bacterias patógenas de los patos en cautiverio bajo la dieta instantánea. Este estudio proporciona una nueva comprensión importante de las variaciones estacionales en la estructura de la comunidad bacteriana intestinal de los patos salvajes en cautiverio. La información disponible aquí puede ser datos esenciales para prevenir y controlar infecciones causadas por bacterias patógenas en aves acuáticas en cautiverio.
Descripción
Los vertebrados y sus bacterias intestinales interactúan de maneras complejas y mutuamente beneficiosas. La composición microbiana intestinal está influenciada por varias influencias externas. Además de la comida, los elementos abióticos del entorno, como la temperatura, la humedad y la fluctuación estacional, también son determinantes importantes. Se recolectaron muestras fecales de dos especies de patos en cautiverio, el pato de Baikal y el pato común, a lo largo de cuatro estaciones (verano, otoño, invierno y primavera). Estos patos fueron alimentados consistentemente con la misma dieta durante todo el experimento. Se empleó secuenciación de alto rendimiento (Illumina Mi-seq) para analizar la región V4-V5 del gen 16sRNA. Los filos dominantes en todas las estaciones fueron Proteobacteria y Firmicutes. Curiosamente, la diversidad alfa fue mayor en invierno para ambas especies. El análisis NMDS, PCoA y ANOSIM mostró el agrupamiento distinto de la composición bacteriana entre diferentes estaciones, mientras que no se descubrieron diferencias significativas entre las especies de patos dentro de la misma estación. Además, el análisis LefSe demostró biomarcadores específicos en diferentes estaciones, siendo el mayor número revelado en invierno. El análisis de la red de co-ocurrencia también mostró que durante el invierno, la red ilustró una estructura más intrincada con el mayor número de nodos y aristas. Sin embargo, este estudio identificó diez especies bacterianas potencialmente patógenas, que mostraron una diversidad y abundancia significativamente aumentadas durante el verano. En general, nuestros resultados revelaron que la estación reguló principalmente la composición de la comunidad bacteriana intestinal y las bacterias patógenas de los patos en cautiverio bajo la dieta instantánea. Este estudio proporciona una nueva comprensión importante de las variaciones estacionales en la estructura de la comunidad bacteriana intestinal de los patos salvajes en cautiverio. La información disponible aquí puede ser datos esenciales para prevenir y controlar infecciones causadas por bacterias patógenas en aves acuáticas en cautiverio.