Caracterización de la Arquitectura de la Planta Gobernante en Guisante de Pájaro (Cajanus cajan (L.) Millsp.)
Autores: Mendapara, Isha; Modha, Kaushal; Patel, Sunayan; Parekh, Vipulkumar; Patel, Ritesh; Chauhan, Digvijay; Bardhan, Kirti; Siddiqui, Manzer H.; Alamri, Saud; Rahman, Md Atikur
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Caracterización de la Arquitectura de la Planta Gobernante en Guisante de Pájaro (Cajanus cajan (L.) Millsp.)
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Hábitos de crecimiento
Evolución
Arquitectura de inflorescencias
InDel
Estructura de proteínas
Edición del genoma
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 9
Citaciones: Sin citaciones
Los hábitos de crecimiento son uno de los rasgos adaptativos esenciales sobre los que actúa la evolución durante la especiación de las plantas. Han traído cambios notables en la morfología y fisiología de las plantas. La arquitectura de la inflorescencia varía considerablemente entre los parientes silvestres y los cultivares de guisante de paloma. El presente estudio aisló el locus () utilizando seis variedades que muestran hábitos de crecimiento determinantes (DT) e indeterminados (IDT). Los alineamientos múltiples de secuencias revelaron la presencia de InDel, que describe una deleción de 10 pb en las variedades DT. Al mismo tiempo, las variedades IDT no mostraron deleción. InDel alteró el punto de inicio de la traducción en las variedades DT, resultando en el acortamiento del exón 1. Este InDel fue validado en diez variedades de especies cultivadas y tres parientes silvestres que difieren en hábitos de crecimiento. La estructura proteica predicha mostró la ausencia de 27 aminoácidos en las variedades DT, lo que se reflejó en el mutante CcTFL1 por la ausencia de dos hélices alfa, un lazo de conexión y una hoja beta acortada. A través de un análisis de motivos posterior, se encontró que la proteína tipo salvaje tenía un sitio de fosforilación para la proteína quinasa C, pero la proteína mutante no. El análisis in silico reveló que la deleción de aminoácidos impulsada por InDel, que contiene un sitio de fosforilación para la proteína quinasa, puede haber resultado en la no funcionalidad de la proteína CcTFL1, lo que da lugar al hábito de crecimiento determinante. Esta caracterización del locus podría utilizarse para modular los hábitos de crecimiento a través de la edición del genoma.
Descripción
Los hábitos de crecimiento son uno de los rasgos adaptativos esenciales sobre los que actúa la evolución durante la especiación de las plantas. Han traído cambios notables en la morfología y fisiología de las plantas. La arquitectura de la inflorescencia varía considerablemente entre los parientes silvestres y los cultivares de guisante de paloma. El presente estudio aisló el locus () utilizando seis variedades que muestran hábitos de crecimiento determinantes (DT) e indeterminados (IDT). Los alineamientos múltiples de secuencias revelaron la presencia de InDel, que describe una deleción de 10 pb en las variedades DT. Al mismo tiempo, las variedades IDT no mostraron deleción. InDel alteró el punto de inicio de la traducción en las variedades DT, resultando en el acortamiento del exón 1. Este InDel fue validado en diez variedades de especies cultivadas y tres parientes silvestres que difieren en hábitos de crecimiento. La estructura proteica predicha mostró la ausencia de 27 aminoácidos en las variedades DT, lo que se reflejó en el mutante CcTFL1 por la ausencia de dos hélices alfa, un lazo de conexión y una hoja beta acortada. A través de un análisis de motivos posterior, se encontró que la proteína tipo salvaje tenía un sitio de fosforilación para la proteína quinasa C, pero la proteína mutante no. El análisis in silico reveló que la deleción de aminoácidos impulsada por InDel, que contiene un sitio de fosforilación para la proteína quinasa, puede haber resultado en la no funcionalidad de la proteína CcTFL1, lo que da lugar al hábito de crecimiento determinante. Esta caracterización del locus podría utilizarse para modular los hábitos de crecimiento a través de la edición del genoma.