Para el éxito de los esfuerzos de conservación acuática, es imperativo comprender las influencias que múltiples estresores a lo largo del paisaje tienen sobre la biota acuática, ya que proporciona una comprensión de los patrones espaciales e informa a las partes interesadas regionales. Los Apalaches centrales y del sur contienen puntos críticos de biodiversidad para la fauna acuática. Por lo tanto, buscamos crear un modelo multimetátrico integral basado en la influencia de factores abióticos sobre los peces y los macroinvertebrados acuáticos que pudiera predecir la calidad de la cuenca. Existe una buena cobertura espacial para el uso del suelo/cobertura del suelo (LULC) y otros componentes fisicoquímicos en toda la región, sin embargo, los datos biológicos están distribuidos de manera desigual, lo que crea dificultades para tomar decisiones informadas de gestión y conservación en grandes paisajes. Utilizamos árboles de regresión aumentados (BRT) para modelar una variedad de respuestas biológicas (variables de peces y macroinvertebrados acuáticos) a predictores abióticos y, al combinar las salidas del modelo, creamos una puntuación única para los valores abióticos y bióticos en toda la región. La varianza media explicada por los modelos BRT para peces fue del 73% (rango = 48-85%) y para macroinvertebrados acuáticos fue del 81% (rango = 76-89%). Clasificamos tanto las variables predictoras como las de respuesta en temas y objetivos, respectivamente, para comprender mejor los patrones a gran escala en el paisaje que influyen en la condición biológica de los arroyos. Los temas más importantes en nuestros modelos fueron la condición geomórfica para los peces y la calidad del agua para los macroinvertebrados acuáticos. Se desarrollaron modelos regionales para peces, pero no para macroinvertebrados acuáticos debido al bajo número de sitios de muestreo. Hubo una fuerte correlación entre las puntuaciones regionales y globales de cuenca para los modelos de peces, pero no entre los modelos de peces y macroinvertebrados acuáticos. Proponemos que el uso de tales puntuaciones multimetátricas puede informar a los gestores, ONG y propietarios de tierras privadas sobre las prácticas de uso del suelo, contribuyendo así a los esfuerzos de conservación a gran escala en el paisaje.