El aumento de la temperatura global afectará los niveles de Fusarium head blight (FHB) en el trigo (L.). Una pregunta apremiante es si las fuentes actuales de resistencia serán efectivas en un ambiente más cálido. Evaluamos la respuesta fenotípica a la enfermedad en 238 líneas de mejoramiento de trigo blando de invierno y cultivares cultivados en 2015-2016 y 2016-2017 bajo condiciones de control y calentadas (+3 grados Celsius). El calentamiento se logró con cables calefactores enterrados a 3 cm en la rizosfera. Medimos la fecha de espigamiento, la altura de la planta, el rendimiento, la calificación de FHB, los granos dañados por Fusarium (FDK), deoxinivalenol (DON), la calificación de manchas en las hojas, la calificación de oídio y la calificación de roya en las hojas. Hubo diferencias significativas (<0.01) entre genotipos para todos los rasgos medidos. El estudio de asociación de todo el genoma (GWAS) identificó 19 y 10 SNPs significativos en los tratamientos de control y calentados, respectivamente. Los niveles de FDK y DON fueron frecuentemente significativamente más altos en el calentamiento que en el control cuando contrastamos alelos en importantes loci de rasgos cuantitativos (QTL) como, y y todos los loci de vernalización y fotoperiodo. La temperatura de la rizosfera aumentada resultó en una fecha de espigamiento significativamente más temprana (<0.01) (~3.5 días) en ambos años del estudio. La correlación de rango entre los tratamientos calentados y de control fue moderada (r = 0.56). Aunque alentador, indica que la selección para el rendimiento bajo calentamiento debe llevarse a cabo en un ambiente calentado.