Descifrando los Mecanismos Genéticos de la Tolerancia a la Sal en L.: Genes Clave y Asociaciones de SNP a partir de Análisis Transcriptómicos Comparativos
Autores: Jeon, Donghyun; Kim, Jin-Baek; Kang, Beum-Chang; Kim, Changsoo
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Descifrando los Mecanismos Genéticos de la Tolerancia a la Sal en L.: Genes Clave y Asociaciones de SNP a partir de Análisis Transcriptómicos Comparativos
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Sorgo
Tolerancia a la sal
Genes
SNPs
Análisis del transcriptoma
Extremos climáticos
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 12
Citaciones: Sin citaciones
L. es un cultivo de cereal vital para la seguridad alimentaria global. Su adaptabilidad a diversos climas lo hace valioso económica, social y ambientalmente. Sin embargo, la salinización del suelo causada por extremos climáticos representa una amenaza para el sorgo. Este estudio tuvo como objetivo identificar genes candidatos tolerantes a la sal y polimorfismos de un solo nucleótido (SNPs) mediante un análisis transcriptómico comparativo en una línea mutante de sorgo y su tipo silvestre. La línea mutante se generó a través de la exposición a rayos gamma y selección por tolerancia a la sal. Se realizaron mediciones fenotípicas, seguidas de secuenciación de ARNm y llamada de variantes. En este estudio, se inferieron genes potenciales y SNPs no sinónimos asociados con la tolerancia a la sal, incluyendo , , , , y . Estos genes demostraron diferencias notables en nsSNPs en comparación con el tipo silvestre, lo que sugiere sus posibles roles en la tolerancia a la sal. Además, (beta-glucosiltransferasa de cianohidrina) se sugirió como un gen clave involucrado en la tolerancia a la sal debido a su posible papel en la biosíntesis de dhurrina bajo estrés salino. En investigaciones futuras, serán necesarios estudios adicionales de genética inversa para verificar la función de esos genes candidatos en relación con el estrés salino. En conclusión, este estudio subraya la importancia de investigar los mecanismos de tolerancia a la sal y los posibles genes clave asociados con la tolerancia a la sal en el sorgo. Nuestros hallazgos pueden proporcionar información para futuras estrategias de mejoramiento destinadas a mejorar la tolerancia a la sal y la productividad de los cultivos.
Descripción
L. es un cultivo de cereal vital para la seguridad alimentaria global. Su adaptabilidad a diversos climas lo hace valioso económica, social y ambientalmente. Sin embargo, la salinización del suelo causada por extremos climáticos representa una amenaza para el sorgo. Este estudio tuvo como objetivo identificar genes candidatos tolerantes a la sal y polimorfismos de un solo nucleótido (SNPs) mediante un análisis transcriptómico comparativo en una línea mutante de sorgo y su tipo silvestre. La línea mutante se generó a través de la exposición a rayos gamma y selección por tolerancia a la sal. Se realizaron mediciones fenotípicas, seguidas de secuenciación de ARNm y llamada de variantes. En este estudio, se inferieron genes potenciales y SNPs no sinónimos asociados con la tolerancia a la sal, incluyendo , , , , y . Estos genes demostraron diferencias notables en nsSNPs en comparación con el tipo silvestre, lo que sugiere sus posibles roles en la tolerancia a la sal. Además, (beta-glucosiltransferasa de cianohidrina) se sugirió como un gen clave involucrado en la tolerancia a la sal debido a su posible papel en la biosíntesis de dhurrina bajo estrés salino. En investigaciones futuras, serán necesarios estudios adicionales de genética inversa para verificar la función de esos genes candidatos en relación con el estrés salino. En conclusión, este estudio subraya la importancia de investigar los mecanismos de tolerancia a la sal y los posibles genes clave asociados con la tolerancia a la sal en el sorgo. Nuestros hallazgos pueden proporcionar información para futuras estrategias de mejoramiento destinadas a mejorar la tolerancia a la sal y la productividad de los cultivos.