La metiltransferasa SABATH puede metilar metabolitos de pequeñas moléculas de plantas para generar diferentes productos, y juega un papel crucial en el crecimiento y desarrollo de las plantas, así como en la respuesta al estrés. En este estudio, se identificaron 13 genes SABATH distribuidos en cinco cromosomas de pepinos, y se analizaron los efectos sinérgicos entre sus dominios, estructuras génicas, motivos conservados, relaciones filogenéticas, análisis de colinealidad, elementos cis-actuantes, patrones de expresión y bacterias promotoras del crecimiento de la rizosfera (PGPR). La estructura génica y los motivos conservados del mismo grupo de CsSABATH tienen números de intrones y motivos conservados similares. Detectamos 10 elementos cis en el promotor del gen CsSABATH, lo que indica que pueden estar involucrados en diferentes vías de señalización. El qRT-PCR reveló la expresión específica de tejidos, sensible a la sequía y al estrés salino del gen SABATH en pepinos. Además, también verificamos que el nivel de expresión después de la inoculación con la bacteria PGPR-GD17 bajo estrés por sequía y sal fue significativamente más bajo que el estrés normal por sequía y sal, lo que indica que este gen puede responder a PGPR y desempeñar un papel importante en el estrés abiótico. Este estudio proporciona valiosos conocimientos sobre las características moleculares y la historia evolutiva de la familia de genes SABATH en pepinos, sentando una base para un análisis más profundo de la función del gen CsSABATH en pepinos.