El microbioma del agua de mar es crucial en los ecosistemas marinos debido a su papel en las cadenas alimenticias y los ciclos biogeoquímicos; por lo tanto, estudiamos la composición del microbioma marino pelágico recolectado en los 50 m superiores en los lados opuestos del estrecho de Fram: las plataformas de Spitsbergen y Groenlandia. Descubrimos que difería significativamente, siendo la salinidad la principal variable ambiental responsable de estas diferencias. La plataforma de Spitsbergen estaba dominada por aguas atlánticas, con una columna de agua bastante homogénea en términos de salinidad y temperatura hasta 300 m; por lo tanto, la comunidad microbiana marina también era homogénea en todas las profundidades muestreadas (0, 25, 50 m). Por el contrario, las estaciones en la plataforma de Groenlandia estaban expuestas a diferentes masas de agua de origen tanto ártico como atlántico, lo que resultó en una comunidad microbiana más diversa allí. Inesperadamente, por primera vez, identificamos cianobacterias en aguas árticas (plataforma de Spitsbergen, 75-77 grados N). Hasta ahora, la distribución de estas cianobacterias en los océanos solo se había descrito entre 40 grados N y 40 grados S. Considerando la acelerada tasa de calentamiento climático en el Ártico, nuestros resultados indicaron que el microbioma del agua de mar puede ser visto como un amplificador del cambio global y que la atlanticización está en progreso.