El estudio de los suelos en la zona de inundación periódica de tres embalses es de importancia prometedora para su posterior retorno a actividades económicas. La investigación sobre las comunidades bacterianas y arqueales de suelos que están inundados periódica o continuamente por embalses sigue siendo insuficiente. Para evaluar el estado químico de los suelos y su microbiota, el estudio se llevó a cabo en los sitios de los embalses Yumaguzino, Nugush y Slak en el área de los Urales del Sur (Federación Rusa). Se investigaron las comunidades bacterianas y arqueales de suelos inundados periódicamente y no inundados después de una investigación comparativa de factores químicos, hidrológicos y climáticos. Se descubrió que los suelos inundados tenían condiciones anóxicas durante todo el año, con breves intervalos de secado de duración limitada y bajos niveles de temperaturas efectivas. En términos de química, los suelos inundados se distinguen por una mayor acidez, una caída en la materia orgánica y un aumento en el nitrógeno hidrolizable por álcalis. En comparación con sus contrapartes en suelos no inundados, las comunidades bacterianas y arqueales en suelos inundados son significativamente diferentes. En términos generales, la biodiversidad de los suelos inundados aumenta con la duración y profundidad de las inundaciones. Las variaciones significativas a nivel de filo son causadas principalmente por una disminución en la presencia relativa de y un aumento en y representación. Se descubrió que el filo estaba ausente o tenía una prevalencia relativa significativamente disminuida en los sitios de suelos inundados intermitentemente.