Perfilado integral de CircRNA y selección de CircRNAs clave revelan los posibles roles regulatorios de los CircRNAs a lo largo del desarrollo y la maduración ovárica en
Autores: Li, Jing; Shi, Bao; Wang, Chongnv; Shao, Changwei; Liu, Xuezhou; Zhang, Daiqiang
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2021
Acceso abierto
Artículo científico
2021
Perfilado integral de CircRNA y selección de CircRNAs clave revelan los posibles roles regulatorios de los CircRNAs a lo largo del desarrollo y la maduración ovárica en
Categoría
Ciencias Naturales y Subdisciplinas
Subcategoría
Biología
Palabras clave
Circrnas
Procesos biológicos
Desarrollo ovárico
Expresión específica de tejidos
Expresión diferencial
Roles regulatorios
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 17
Citaciones: Sin citaciones
Los circARN son nuevos ARN pequeños no codificantes endógenos involucrados en la regulación de múltiples procesos biológicos. Sin embargo, se sabe poco sobre los circARN en el desarrollo y maduración ovárica de los peces. Nuestro estudio, por primera vez, proporciona una visión general del genoma sobre los tipos y abundancias relativas de circARN en los tejidos de la lenguado durante tres etapas de desarrollo ovárico. Detectamos 6790 circARN en el cerebro, 5712 en la glándula pituitaria, 4937 en el ovario y 4160 en el hígado. Algunos circARN exhiben expresión específica de tejido, y el qRT-PCR confirmó en gran medida 6 circARN diferencialmente expresados (DE). Se realizaron análisis de Gene Ontology y de la vía KEGG de los ARNm DE. Algunos genes parentales de circARN DE estaban estrechamente asociados con procesos biológicos en vías de señalización clave y pueden desempeñar roles esenciales en el desarrollo y maduración ovárica. Encontramos que los circARN seleccionados estaban involucrados en 10 vías. El experimento de digestión con RNasa R y la secuenciación de Sanger verificaron que el circARN tenía una estructura de anillo y era resistente a la RNasa R. Los resultados de qRT-PCR confirmaron en gran medida los patrones de expresión diferencial de circARN a partir de los datos de RNA-seq. Estos hallazgos indican que los circARN son ampliamente presentes en los tejidos relacionados con la producción de la lenguado, con roles regulatorios potencialmente importantes en el desarrollo y maduración ovárica.
Descripción
Los circARN son nuevos ARN pequeños no codificantes endógenos involucrados en la regulación de múltiples procesos biológicos. Sin embargo, se sabe poco sobre los circARN en el desarrollo y maduración ovárica de los peces. Nuestro estudio, por primera vez, proporciona una visión general del genoma sobre los tipos y abundancias relativas de circARN en los tejidos de la lenguado durante tres etapas de desarrollo ovárico. Detectamos 6790 circARN en el cerebro, 5712 en la glándula pituitaria, 4937 en el ovario y 4160 en el hígado. Algunos circARN exhiben expresión específica de tejido, y el qRT-PCR confirmó en gran medida 6 circARN diferencialmente expresados (DE). Se realizaron análisis de Gene Ontology y de la vía KEGG de los ARNm DE. Algunos genes parentales de circARN DE estaban estrechamente asociados con procesos biológicos en vías de señalización clave y pueden desempeñar roles esenciales en el desarrollo y maduración ovárica. Encontramos que los circARN seleccionados estaban involucrados en 10 vías. El experimento de digestión con RNasa R y la secuenciación de Sanger verificaron que el circARN tenía una estructura de anillo y era resistente a la RNasa R. Los resultados de qRT-PCR confirmaron en gran medida los patrones de expresión diferencial de circARN a partir de los datos de RNA-seq. Estos hallazgos indican que los circARN son ampliamente presentes en los tejidos relacionados con la producción de la lenguado, con roles regulatorios potencialmente importantes en el desarrollo y maduración ovárica.