Perfil de expresión y propiedades regulatorias de circARNs modificados por m6A en el Longissimus Dorsi de cerdos Queshan Black y Large White
Autores: Qi, Kunlong; Dou, Yaqing; Zhang, Zhe; Wei, Yilin; Song, Chenglei; Qiao, Ruimin; Li, Xiuling; Yang, Feng; Wang, Kejun; Li, Xinjian; Han, Xuelei
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Perfil de expresión y propiedades regulatorias de circARNs modificados por m6A en el Longissimus Dorsi de cerdos Queshan Black y Large White
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Zootecnia
Palabras clave
M6a
Circrnas
Longissimus dorsi
Cerdos
Deposición de grasa
Red reguladora de ceRNA
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 9
Citaciones: Sin citaciones
Es bien sabido que la N6-metiladenosina (m6A) es la modificación más abundante en moléculas de ARN lineales, pero ahora se ha encontrado que muchas moléculas de circRNA también tienen una amplia gama de sitios de modificación m6A. Sin embargo, hay pocos estudios e información relevante sobre el perfil de expresión y las propiedades regulatorias funcionales de los circRNAs modificados por m6A (m6A-circRNAs) en el longissimus dorsi. En este estudio, se identificaron y caracterizaron un total de 12 m6A-circRNAs putativos en el longissimus dorsi de cerdos Queshan Black y Large White; 8 de ellos se expresaron significativamente más en el longissimus dorsi de Queshan Black que en los cerdos Large White, mientras que los otros 4 fueron lo contrario. También se encontró que estos 12 m6A-circRNAs putativos actúan como moléculas esponja de miARN para regular la deposición de grasa al construir la red reguladora ceRNA. El análisis de enriquecimiento también reveló que los genes parentales de los 12 m6A-circRNAs y sus genes objetivo de miARN adsorbidos estaban ampliamente involucrados en vías relacionadas con la deposición de grasa y la proliferación y diferenciación celular, como la vía de señalización HIF-1, la vía de fosfato de pentosa, la vía de señalización MAPK, la biosíntesis de glicosfingolípidos series lacto y neolacto, y la vía de señalización TNF, lo que sugiere que los m6A-circRNAs analizados pueden estar en gran medida involucrados en la formación de la calidad de la carne de cerdo. Estos resultados proporcionan nueva información para estudiar las propiedades regulatorias de los m6A-circRNAs en la formación de la calidad de la carne de cerdo.
Descripción
Es bien sabido que la N6-metiladenosina (m6A) es la modificación más abundante en moléculas de ARN lineales, pero ahora se ha encontrado que muchas moléculas de circRNA también tienen una amplia gama de sitios de modificación m6A. Sin embargo, hay pocos estudios e información relevante sobre el perfil de expresión y las propiedades regulatorias funcionales de los circRNAs modificados por m6A (m6A-circRNAs) en el longissimus dorsi. En este estudio, se identificaron y caracterizaron un total de 12 m6A-circRNAs putativos en el longissimus dorsi de cerdos Queshan Black y Large White; 8 de ellos se expresaron significativamente más en el longissimus dorsi de Queshan Black que en los cerdos Large White, mientras que los otros 4 fueron lo contrario. También se encontró que estos 12 m6A-circRNAs putativos actúan como moléculas esponja de miARN para regular la deposición de grasa al construir la red reguladora ceRNA. El análisis de enriquecimiento también reveló que los genes parentales de los 12 m6A-circRNAs y sus genes objetivo de miARN adsorbidos estaban ampliamente involucrados en vías relacionadas con la deposición de grasa y la proliferación y diferenciación celular, como la vía de señalización HIF-1, la vía de fosfato de pentosa, la vía de señalización MAPK, la biosíntesis de glicosfingolípidos series lacto y neolacto, y la vía de señalización TNF, lo que sugiere que los m6A-circRNAs analizados pueden estar en gran medida involucrados en la formación de la calidad de la carne de cerdo. Estos resultados proporcionan nueva información para estudiar las propiedades regulatorias de los m6A-circRNAs en la formación de la calidad de la carne de cerdo.