Una interacción dinámica defectuosa entre una máquina y una fundación puede llevar a fallos inesperados y peligrosos, impactando en la vida humana y el medio ambiente. Algunas máquinas, como los compresores alternativos, tienen una baja velocidad de rotación; esto puede llevar a frecuencias peligrosas para los bloques de fundación. Por esta razón, se debe realizar un análisis cuidadoso durante la fase de diseño para evitar el rango de frecuencias de resonancias y bajas velocidades de vibración. Los diseñadores pueden abordar este problema apoyándose tanto en la Teoría Analítica como en el Análisis por Elementos Finitos. Este artículo compara estos métodos estudiando la respuesta dinámica de diferentes geometrías de fundación en un estudio de caso de una fundación de compresor alternativo. Se exploran los límites de aplicabilidad de la teoría analítica y se realiza una evaluación de la diferencia en la estimación de las frecuencias naturales del sistema utilizando la Teoría Analítica y el Análisis por Elementos Finitos para diferentes geometrías de fundación. La comparación muestra resultados similares hasta que la geometría de la fundación es rígida; se proporcionan límites de geometrías de referencia para que los diseñadores puedan elegir cuál de los métodos se adapta mejor a su tipo de análisis.