Este estudio analizó y evaluó los cambios que ocurrieron en dos humedales costeros, caracterizados por patrones de paisaje complejos y fragmentados, en el sur de Italia, que fueron monitoreados durante un período de siete años, desde 2007 hasta 2014. Además, se evaluaron las actuaciones de dos taxonomías de Cobertura del Suelo (LC) y hábitat, comparadas por su idoneidad para mapear los cambios identificados. Se adoptó un método de post-mapeo para detectar los cambios de hábitat/LC que ocurrieron en el período de estudio. Se identificaron varios cambios, tanto cambios inter-clase (conversiones de clase) como cambios intra-clase (modificaciones de clase), y se cuantificaron mediante matrices de transición. Las conversiones se mapearon fácilmente, mientras que el mapeo de modificaciones dependió de la taxonomía adoptada: el Sistema de Clasificación de Cobertura del Suelo (LCCS) permitió la detección de cambios morfo-estructurales en la vegetación leñosa, pero el Sistema Europeo de Información sobre la Naturaleza (EUNIS) mostró una mayor resolución temática para los tipos de marismas salinas. Los cambios detectados estaban relacionados con impactos, presiones y factores subyacentes específicos. Los índices de paisaje destacaron diferentes tendencias en la riqueza y complejidad del paisaje en los dos sitios. Los cambios están ocurriendo muy rápidamente en los sitios costeros observados y las dinámicas en curso están estrictamente relacionadas con su pequeño tamaño y complejidad. Para un monitoreo y detección efectivos de cambios en estos entornos, se sugiere la combinación de EUNIS y LCCS.