Los lagos son fuentes naturales importantes de metano atmosférico (CH), que deben ser consideradas en las estimaciones del presupuesto global de CH. Sin embargo, las emisiones de CH de los lagos pueden ser altamente variables, y las emisiones de la región de entrada del río han sido menos estudiadas, lo que dificulta seriamente nuestra comprensión de las estimaciones del presupuesto de CH de los lagos. Aquí, se realizaron mediciones de campo durante más de seis años (2012 a 2017) en el Lago Taihu, un gran lago eutrófico poco profundo con una complicada red fluvial, para abordar el problema. Los resultados muestran que la región de entrada del río del lago era un punto caliente de emisión de CH. La emisión de CH en la región de entrada del río, con un valor medio anual de 0.183 mmol m d, fue siete veces mayor que en la región pelágica (0.028 mmol m d). La emisión máxima de CH ocurrió en las estaciones cálidas, y la más baja en las estaciones frías en la región pelágica, pero la emisión máxima ocurrió en las estaciones frías en la región de entrada del río. La emisión estacional de CH en la región pelágica puede explicarse por la temperatura del agua; sin embargo, se encontró una menor dependencia de la temperatura de la emisión de CH en la región de entrada del río. La variabilidad de la emisión de CH estaba vinculada a las cargas de contaminación, y el agua rica en CH en el río entrante probablemente sostenía la gran emisión de CH de la región de entrada del río.