Estudiamos la litostratigrafía, microfacies, ambiente de deposición y la presencia incierta del límite Paleoceno/Eoceno de la Formación Jafnayn y presentamos el primer análisis detallado de una sección de 127 m de espesor utilizando el sistema estándar de microfacies (SMF)/zona de facies (FZ). La formación está dominada por grainstones y packstones foraminíferos de SMF 18-FOR, seguidos por grainstones y packstones peloidales de SMF 16. Floatstones de algas coralinas rojas de SMF 8 ocurren esporádicamente. SMF 18-DASY aparece solo una vez. SMF 16 y 18-FOR sugieren una laguna restringida, mientras que SMF 8 y 18-DASY reflejan condiciones lagunares marinas abiertas episódicas. La sección consta de cuatro unidades litostratigráficas. Un considerable cuarzo detrítico cerca de la base (Unidad 1: 22%; arena, arenisca, conglomerado) y la parte superior (Unidad 4: 40%; arena) coincide con una laguna restringida afectada por procesos cercanos a la costa (base) y condiciones cercanas a la costa (parte superior). Las condiciones marinas abiertas muestran una elevada diversidad de bioclastos en las unidades 3 y 4. La Unidad 2 presenta calizas de capas muy gruesas de la laguna restringida. Las barreras de la laguna probablemente consisten en foraminíferos y otros alocamas que fueron reprocesados de la laguna para formar bancos. Los restos de coral en las unidades 3 y 4 sugieren que las acumulaciones de coral en la parte superior de la formación también protegieron la laguna. La edad del temprano Eoceno de varias especies basales en los 9 m más bajos de la sección estudiada indica que la sección está incompleta, con la parte del Paleoceno tardío y metros de marga amarilla basal faltantes. El límite Paleoceno/Eoceno no está expuesto.