Identificación y Verificación de Biomarcadores e Infiltración Inmunitaria en la Fibrilación Auricular Relacionada con la Obesidad
Autores: Xie, Zhonghui; Liu, Chuanbin; Lu, Xu; Chen, Zhijie; Zhang, Nan; Wang, Xinyan; Li, Xiaoqian; Li, Yang
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Identificación y Verificación de Biomarcadores e Infiltración Inmunitaria en la Fibrilación Auricular Relacionada con la Obesidad
Categoría
Ciencias Naturales y Subdisciplinas
Subcategoría
Biología
Palabras clave
Mecanismos
Co-genes diferencialmente expresados
Genes clave
CIBERSORT
Biomarcadores
Obesidad
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 15
Citaciones: Sin citaciones
La obesidad es un factor de riesgo independiente para la fibrilación auricular (FA). Sin embargo, los mecanismos subyacentes a esta interacción aún se están descubriendo. Se identificaron genes co-expresados diferencialmente (co-DEGs) de microarreglos de FA y obesidad mediante análisis bioinformáticos. Posteriormente, se llevaron a cabo análisis de enriquecimiento funcional, enriquecimiento por tipo celular y redes de interacción proteína-proteína de los co-DEGs. Luego, validamos los genes clave mediante qRT-PCR de muestras de sangre de los pacientes. Finalmente, se utilizó CIBERSORT para evaluar el microarreglo de FA y determinar la infiltración inmune y la correlación entre los genes clave validados y las células inmunitarias. Se identificaron un total de 23 co-DEGs regulados al alza en los microarreglos de FA y obesidad, y estos genes estaban enriquecidos en funciones relacionadas con la inflamación y la inmunidad. Las células enriquecidas fueron sangre total, mieloides CD33+ y monocitos CD14+. Los genes clave se identificaron como , , , , , , , , , y . Todos los genes clave solo estaban elevados en muestras de sangre de pacientes con obesidad y FA. El análisis de CIBERSORT reveló que el apéndice auricular izquierdo de los pacientes con FA tenía una mayor infiltración de células B naïve y una menor infiltración de células B de memoria. Los genes clave estaban relacionados positivamente con las células B naïve y negativamente con las células B de memoria. Diez genes clave pueden servir como biomarcadores para la FA relacionada con la obesidad. Estos hallazgos también pueden ayudar a comprender los mecanismos patofisiológicos de la FA relacionada con la obesidad.
Descripción
La obesidad es un factor de riesgo independiente para la fibrilación auricular (FA). Sin embargo, los mecanismos subyacentes a esta interacción aún se están descubriendo. Se identificaron genes co-expresados diferencialmente (co-DEGs) de microarreglos de FA y obesidad mediante análisis bioinformáticos. Posteriormente, se llevaron a cabo análisis de enriquecimiento funcional, enriquecimiento por tipo celular y redes de interacción proteína-proteína de los co-DEGs. Luego, validamos los genes clave mediante qRT-PCR de muestras de sangre de los pacientes. Finalmente, se utilizó CIBERSORT para evaluar el microarreglo de FA y determinar la infiltración inmune y la correlación entre los genes clave validados y las células inmunitarias. Se identificaron un total de 23 co-DEGs regulados al alza en los microarreglos de FA y obesidad, y estos genes estaban enriquecidos en funciones relacionadas con la inflamación y la inmunidad. Las células enriquecidas fueron sangre total, mieloides CD33+ y monocitos CD14+. Los genes clave se identificaron como , , , , , , , , , y . Todos los genes clave solo estaban elevados en muestras de sangre de pacientes con obesidad y FA. El análisis de CIBERSORT reveló que el apéndice auricular izquierdo de los pacientes con FA tenía una mayor infiltración de células B naïve y una menor infiltración de células B de memoria. Los genes clave estaban relacionados positivamente con las células B naïve y negativamente con las células B de memoria. Diez genes clave pueden servir como biomarcadores para la FA relacionada con la obesidad. Estos hallazgos también pueden ayudar a comprender los mecanismos patofisiológicos de la FA relacionada con la obesidad.