La conformación lineal de los animales ejerce una influencia en la salud, la reproducción, la producción y el bienestar, además de la longevidad, que afecta directamente la rentabilidad de las granjas productoras de leche. Los objetivos de este estudio fueron (1) realizar estudios de asociación a nivel genómico (GWAS) de rasgos de conformación, a saber, el Rump, Pies y Piernas, Sistema Mamario, Fuerza Lechera y Clasificación Final, y (2) identificar genes y vías relacionadas involucradas en procesos fisiológicos asociados con rasgos de conformación en ganado Holstein brasileño. Se utilizaron datos fenotípicos y genotípicos de 2339 animales Holstein distribuidos en los estados de Rio Grande do Sul, Paraná, São Paulo y Minas Gerais. Los datos genotípicos se obtuvieron con un panel de marcadores SNP de 100 K. Se empleó el método de estudio de asociación a nivel genómico de un solo paso (ssGWAS) en los análisis. Se identificaron genes cercanos a un SNP significativo en un intervalo de 100 kb hacia arriba y hacia abajo utilizando la base de datos Ensembl disponible en la herramienta BioMart. Se utilizó la base de datos DAVID para identificar las principales vías metabólicas y se empleó el programa STRING para crear la red reguladora de genes. En total, se encontraron 36 SNP significativos en 15 cromosomas; 27 de estos SNP estaban vinculados a genes que pueden influir en los rasgos estudiados. Se identificaron catorce genes más estrechamente relacionados con los rasgos estudiados, así como cuatro genes que mostraron interacciones en importantes vías metabólicas como la miogénesis, la adipogénesis y la angiogénesis. Entre el total de genes, cuatro estaban asociados con la miogénesis, tres con la angiogénesis y cuatro con la adipogénesis y el tamaño y desarrollo corporal. Estos resultados contribuyen a una mejor comprensión de los mecanismos biológicos subyacentes a la variabilidad fenotípica en los rasgos de conformación en el ganado Holstein brasileño.