El objetivo del estudio era determinar la estructura de Actinobacteria en suelos cultivados (C) y no cultivados (NC) divididos en tres grupos (autogénico, hidrogénico, litogénico) teniendo en cuenta su proceso de formación para evaluar la sensibilidad de Actinobacteria al uso agrícola del suelo y la génesis del suelo e identificar los factores que afectan su abundancia. Dieciséis muestras de suelo C y dieciséis muestras NC como controles fueron tomadas para el estudio. Se aplicaron secuenciación de próxima generación (NGS) de los amplicones metagenómicos de ARNr 16S (tecnología Ion Torrent(tm)) y Electroforesis en Gel de Gradiente Desnaturalizante (DGGE) para una determinación precisa de la biodiversidad. En general, se encontró una mayor abundancia de Actinobacteria en los suelos NC en comparación con los suelos C. Además, se indicó que la diversidad actinobacteriana dependía tanto de la génesis del suelo como del uso de la tierra; sin embargo, este efecto dependía directamente de la familia y los géneros particulares. Dos factores: potencial redox (Eh) y carbono total (TC) parecían tener un efecto significativo en la diversidad de Actinobacteria. Más precisamente, las Actinobacteria de los suelos NC mostraron una mayor afinidad entre sí y estaban claramente influenciadas por Eh, mientras que las de los suelos C estaban mayormente influenciadas por TC.