Durante la pandemia de COVID-19, los sistemas educativos tuvieron que adaptarse de inmediato a la situación social y de salud. Esto llevó a la aparición del modelo de enseñanza asincrónica. A lo largo de la pandemia a nivel educativo, podemos distinguir tres fases: eminentemente en línea, híbrida y presencial. Sin embargo, la percepción de la calidad educativa en estos tres momentos educativos, considerando el perfil psicométrico y las diferencias culturales entre los países iberoamericanos, no ha sido estudiada. El estudio tiene como objetivo analizar el perfil psicológico y la percepción de calidad en los procesos de enseñanza-aprendizaje en la etapa universitaria, durante los tres procesos de transición educativa durante COVID-19: en línea, híbrido y presencial. Así, se estudiaron 1093 estudiantes universitarios de países iberoamericanos. A través de un cuestionario, se analizaron variables demográficas, académicas y psicológicas durante las tres fases de la pandemia. Los datos sugieren que los estudiantes latinoamericanos presentaron niveles más altos de ansiedad rasgo y percepción de estrés, así como niveles más altos de soledad, durante la fase de enseñanza en línea (confinamiento), pero calificaciones más altas y mayores niveles de motivación en comparación con los europeos. De hecho, los latinoamericanos mostraron mayor conveniencia y preferencia por los métodos de aprendizaje en línea. Sin embargo, durante la fase de enseñanza presencial, los estudiantes europeos presentaron mayor motivación y calificaciones, mostrando una mayor preferencia por este método de aprendizaje que los estudiantes latinoamericanos. Factores como la resiliencia, una evolución pandémica más desfavorable y pronunciada, y mayores inequidades sociales, pueden explicar los resultados presentes. Además, el presente estudio sugiere que a pesar del efecto de la pandemia en la salud mental, la educación en línea se postula como una alternativa efectiva de enseñanza-aprendizaje. De hecho, los modelos de enseñanza en línea han llegado para quedarse, no como un sustituto, sino como una herramienta; un enfoque esencial de atención sobre estos modelos debería llevarse a cabo en los países europeos, mientras que los gobiernos de los países latinoamericanos aseguren que las infraestructuras y recursos sean equitativos para poder implementar correctamente este modelo de enseñanza.