La estructura social de las poblaciones animales es un componente fundamental de su biología, influyendo en el flujo genético, el uso del hábitat, la competencia y la cooperación en torno a los recursos, y la comunicación. Sin embargo, las relaciones ecológicas y sociales pueden ser difíciles de describir en la mayoría de los mamíferos marinos, que pasan la mayor parte de su vida bajo el agua. El marsopa sin aleta (Neophocaena asiaeorientalis) es una de estas especies de cetáceos con una estructura social en gran medida desconocida. Los recientes avances en la tecnología de drones permiten realizar encuestas más sistemáticas, fotogrametría e identificación fotográfica para diversas especies animales. El presente estudio tuvo como objetivo validar nuevos métodos de encuesta y proporcionar una descripción preliminar de la distribución espaciotemporal de las marsopas sin aleta en el área costera de mar abierto de Ariake Sound, Japón. Un dron de despegue y aterrizaje vertical (VTOL) equipado con una cámara de acción generó conjuntos de datos de ubicación GPS a través de encuestas de línea y área, cubriendo un área total de mar de 120 km^2. Los resultados sugieren tamaños de agregación altamente flexibles y variados en las marsopas sin aleta. El análisis de distancia entre individuos y agregaciones reveló una tendencia cohesiva entre los grupos, en comparación con los solitarios y en parejas. Por lo tanto, las encuestas con dron VTOL no solo aclararon algunos aspectos sociales de la población estudiada, sino que también confirmaron la eficacia de estos protocolos de investigación estandarizados que implican misiones de vuelo automatizadas, programadas y repetibles.