Los liposomas se consideran uno de los sistemas de entrega de medicamentos más exitosos. Aplican nanotecnología para potenciar la eficacia terapéutica y reducir la toxicidad de los medicamentos convencionales. La shikonina y la alquínina, un par de compuestos naturales de naftoquinona quirales, derivados de especies de Alkanna y Lithospermum, se utilizan ampliamente debido a sus diversas actividades farmacológicas, principalmente la cicatrización de heridas, antioxidante, antiinflamatoria y su actividad antitumoral recientemente establecida. El propósito de este estudio fue preparar formulaciones liposomales convencionales y PEGiladas cargadas de shikonina y medir los efectos de diferentes lípidos y polietileno glicol (PEG) en parámetros relacionados con la distribución del tamaño de partículas, el índice de polidispersidad, el potencial zeta, la eficiencia de carga del fármaco y la estabilidad de las formulaciones preparadas. Se evaluaron tres tipos de lípidos (1,2-Dioleoil-sn-glicerol-3-fosfocolina (DOPC), 1,2-Distearoil-sn-glicerol-3-fosfocolina (DSPC) y 1,2-distearoil-sn-glicerol-3-fosfo-rac-(1-glicerol) (DSPG)), por separado y en mezclas, formando liposomas aniónicos con buenas características fisicoquímicas, altas eficiencias de encapsulación (que varían del 56.5 al 89.4%), perfiles de liberación in vitro satisfactorios y buena estabilidad física. La adición de los lípidos DSPG cargados negativamente a DOPC, llevó a un incremento en la eficiencia de incorporación del fármaco y redujo la distribución del tamaño de partículas. Además, la muestra PEGilada cargada de shikonina con DOPC/DSPG, demostró las características más satisfactorias. Estos hallazgos se consideran prometedores y podrían ser utilizados para el diseño y mejora de tales formulaciones.