La proteína de diferenciación celular de leucemia mieloide humana (hMcl-1) es una proteína antiapoptótica de múltiples socios, que pertenece a la familia de proteínas del linfoma B-2 (Bcl-2). Estudios han relacionado la expresión aliviada de hMcl-1 con resistencia a los quimioterapéuticos hemopoyéticos, lo que la convierte en un objetivo clave para fármacos en cánceres de sangre. Sin embargo, la mayoría de los inhibidores de hMcl-1 desarrollados de tamaño pequeño a mediano tienen una actividad fuera del objetivo típica hacia otros miembros de la familia Bcl-2. Para mejorar el diseño de inhibidores de hMcl-1, especialmente explorando un andamiaje adecuado con características farmacofóricas, nos centramos en inhibidores naturales de hMcl-1. Hasta la fecha, se han aislado siete clases de compuestos naturales, que muestran una baja afinidad micromolar por hMcl-1 y tienen estudios biofísicos limitados. Examinamos estructuras de co-cristales de hMcl-1 e identificamos nueve estructuras de co-cristales de la proteína hMcl-1, que fueron evaluadas posteriormente por múltiples conformaciones de receptores (lo que indica que las diferencias entre hMcl-1 en estructuras cristalinas son bajas (valores de RMSD entre 0.52 y 1.13 Å, RMSD promedio de 0.638-0.888, con una desviación estándar de 0.102-0.185)), y múltiples conformaciones de ligandos (lo que llevó a la selección de la estructura PDB, 3WIX (valor de RMSD = 0.879, desviación estándar 0.116), para acomodar varios ligandos de Mcl-1 de una gama de archivos PDB de co-cristales). Posteriormente, se evaluaron los tres métodos de acoplamiento adoptados por su capacidad para reproducir la conformación unida al cristal, así como predecir tendencias en los valores de Ki basados en RMSD calculados y energías de acoplamiento. El acoplamiento iterativo y el agrupamiento de la pose acoplada dentro de