La marchitez por Verticillium y el moteado de las hojas del girasol (SVW), causado por Kleb., es una enfermedad de prevalencia global que afecta la producción de girasol. En este estudio, identificamos un locus de rasgo cuantitativo (QTL) importante en el cromosoma 10 y otras regiones genómicas asociadas con la resistencia al SVW al integrar el mapeo biparental y el mapeo de asociación en poblaciones de girasol del Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Se realizaron nueve ensayos de campo replicados en reservorios altamente infestados para evaluar la incidencia y severidad de la enfermedad. Ambas poblaciones de mapeo fueron genotipadas utilizando secuenciación de ADN asociada a sitios de restricción de doble digestión (ddRADseq). El mapeo de asociación con 18,161 SNPs y el mapeo QTL biparental con 1769 SNPs identificaron un QTL importante en el cromosoma 10 que explica hasta el 30% de la variación fenotípica para la incidencia de la enfermedad en floración y para el área bajo la curva de progreso de la enfermedad para la incidencia de la enfermedad, y que contribuye en menor medida a la reducción de la severidad de la enfermedad. Se asociaron QTL adicionales en los cromosomas 17, 8, 9, 14, 13 y 11 con una menor incidencia de la enfermedad, severidad, o ambas. Se identificaron genes candidatos dentro de estas regiones asociadas, 39 de los cuales se encuentran en el QTL principal en el cromosoma 10. Estos hallazgos demuestran el valor de integrar estrategias complementarias de mapeo QTL para validar loci de resistencia y avanzar en la mejora del girasol para la resistencia al SVW.