La aceleración de la urbanización y la industrialización ha tenido impactos sustanciales en las actividades económicas y sociales, ha cambiado el entorno superficial de la tierra y ha afectado el cambio climático global y la biodiversidad. Si no se implementan a tiempo medidas de gestión razonables y efectivas, la urbanización y la industrialización descontroladas dañarán la estructura y función del ecosistema, pondrán en peligro los hábitats humanos y biológicos, y, en última instancia, llevarán a dificultades para lograr un desarrollo sostenible. Este estudio investiga el efecto de la calidad del hábitat de la transición del uso del suelo y analiza la causa y el mecanismo de tales cambios desde una perspectiva de sistema complejo económico-social-ecológico en el área de la Fuente de Agua de Henan (HWS) de la Ruta Media del Proyecto de Transferencia de Agua del Sur al Norte (MRP). El estudio examina de manera integral las características de la transición del uso del suelo desde 2000 hasta 2020. Los resultados indican que la calidad del hábitat en el área HWS del MRP disminuyó lentamente en los últimos 20 años, con una disminución más evidente en los últimos 10 años. Específicamente, la proporción de áreas de hábitat de alta calidad es relativamente grande y estable, y las áreas de hábitat de calidad media y baja aumentan significativamente. El análisis del grado de cambio de la proporción de diferentes niveles de calidad del hábitat en cada condado reveló que la ciudad de Dengzhou tuvo el cambio más dramático, seguida de los condados de Xichuan y Neixiang; otros condados no experimentaron cambios evidentes. Los resultados de la detección de factores de calidad del hábitat mediante GeoDetector mostraron que la transición del uso del suelo juega un papel decisivo en el cambio de la calidad del hábitat. Los tipos de uso del suelo con alta idoneidad de hábitat en comparación con aquellos con baja idoneidad de hábitat inevitablemente conducirán a una disminución de la calidad del hábitat. Además, la elevación, la pendiente, el tipo de forma del terreno y la precipitación anual son factores importantes que afectan la calidad del hábitat en el área HWS del MRP, lo que indica que los factores ecológicos determinan las condiciones de fondo de la calidad del hábitat. El producto interno bruto (PIB) per cápita, la proporción del valor de la producción agrícola, el rendimiento de granos por unidad de área en factores económicos, la densidad de población y la tasa de urbanización en factores sociales afectan la diferenciación espacial de la calidad del hábitat hasta cierto punto. El tipo de suelo, la temperatura media anual, el tipo de vegetación y el índice NDVI tienen efectos débiles sobre la calidad del hábitat, mientras que la densidad de la red de carreteras y la orientación de la pendiente no tienen un efecto significativo en la calidad del hábitat. Los resultados de este estudio proporcionan una base para la mejora de la calidad del hábitat, la protección y restauración del ecosistema, la gestión de recursos terrestres y políticas relacionadas en el área HWS del MRP. También proporcionan referencias para la investigación y práctica de los efectos de calidad del hábitat de la transición del uso del suelo en otras regiones.