Regulación espaciotemporal y análisis funcional de los ARN circulares en el músculo esquelético y la grasa subcutánea durante el crecimiento del cerdo
Autores: Li, Biao; Yang, Jinzeng; He, Jun; Gong, Yan; Xiao, Yu; Zeng, Qinghua; Xu, Kang; Duan, Yehui; He, Jianhua; Ma, Haiming
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2021
Acceso abierto
Artículo científico
2021
Regulación espaciotemporal y análisis funcional de los ARN circulares en el músculo esquelético y la grasa subcutánea durante el crecimiento del cerdo
Categoría
Ciencias Naturales y Subdisciplinas
Subcategoría
Biología
Palabras clave
ARN circulares
Razas de cerdo
CircARN
Músculo esquelético
Grasa subcutánea
Puntos de tiempo de crecimiento
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 14
Citaciones: Sin citaciones
Recientemente, se han reportado miles de ARN circulares en diferentes razas de cerdos. Sin embargo, las investigaciones sobre los patrones de expresión temporal y espacial de circRNA durante el crecimiento animal son limitadas. Aquí, analizamos sistemáticamente los circRNAs en el músculo esquelético y la grasa subcutánea en cuatro puntos de tiempo de crecimiento (30 días, 90 días, 150 días y 210 días después del nacimiento) de una raza de cerdo nativa china, los cerdos Ningxiang. Se identificaron un total de 1171 circRNAs diferencialmente expresados (DE) entre el músculo y la grasa, incluyendo 562 circRNAs regulados al alza y 609 regulados a la baja. El análisis de enriquecimiento de la vía KEGG de estos circRNAs DE reveló que los genes anfitriones estaban principalmente involucrados en vías de señalización del metabolismo del glucógeno, vías de señalización del desarrollo muscular como la vía ErbB y vías de señalización de adipocitoquinas, así como vías de señalización AMPK y biosíntesis de ácidos grasos. Los circRNAs tienen una notable especificidad espaciotemporal en forma de expresión dinámica a los 90 días. El análisis de Miner de Expresión de Series Temporales Cortas mostró múltiples espectros de modelo que están significativamente enriquecidos con cambios temporales en el músculo y la grasa. Nuestros hallazgos proporcionan nuevas ideas y perspectivas sobre el papel de los ARN circulares y sus relaciones de objetivo con el mRNA y miRNA en el músculo esquelético y el tejido graso durante el crecimiento del cerdo.
Descripción
Recientemente, se han reportado miles de ARN circulares en diferentes razas de cerdos. Sin embargo, las investigaciones sobre los patrones de expresión temporal y espacial de circRNA durante el crecimiento animal son limitadas. Aquí, analizamos sistemáticamente los circRNAs en el músculo esquelético y la grasa subcutánea en cuatro puntos de tiempo de crecimiento (30 días, 90 días, 150 días y 210 días después del nacimiento) de una raza de cerdo nativa china, los cerdos Ningxiang. Se identificaron un total de 1171 circRNAs diferencialmente expresados (DE) entre el músculo y la grasa, incluyendo 562 circRNAs regulados al alza y 609 regulados a la baja. El análisis de enriquecimiento de la vía KEGG de estos circRNAs DE reveló que los genes anfitriones estaban principalmente involucrados en vías de señalización del metabolismo del glucógeno, vías de señalización del desarrollo muscular como la vía ErbB y vías de señalización de adipocitoquinas, así como vías de señalización AMPK y biosíntesis de ácidos grasos. Los circRNAs tienen una notable especificidad espaciotemporal en forma de expresión dinámica a los 90 días. El análisis de Miner de Expresión de Series Temporales Cortas mostró múltiples espectros de modelo que están significativamente enriquecidos con cambios temporales en el músculo y la grasa. Nuestros hallazgos proporcionan nuevas ideas y perspectivas sobre el papel de los ARN circulares y sus relaciones de objetivo con el mRNA y miRNA en el músculo esquelético y el tejido graso durante el crecimiento del cerdo.