Estructura poblacional y diversidad genética de en China
Autores: Liu, Bei; Liang, Xingxing; Kong, Jinchao; Jiao, Chen; Li, Hongye; Gai, Yunpeng
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Estructura poblacional y diversidad genética de en China
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Agronomía y Ciencia de los Cultivos
Palabras clave
Estructura genética
Diversidad genética
Haplotipos de GAPDH
Fst
Prueba de AMOVA
Prueba de Mantel
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 22
Citaciones: Sin citaciones
Para analizar la estructura genética y diversidad genética de la especie dominante en los cítricos, se estudió la diversidad genética de la gliceraldehído-3-fosfato deshidrogenasa (GAPDH), incluyendo 63 cepas aisladas y seleccionadas de 8 sitios diferentes y 5 especies de cítricos diferentes. Un total de 19 haplotipos de GAPDH fueron identificados mediante análisis genético, y el haplotipo principal (haplotipo 5) se distribuyó en 28 aislados, principalmente de Hort. ex Tanaka (WG) y Blanco cv. Succosa (BDZ) en Huangyan (HY), Linhai (LH) y Jiande (JD) de la provincia de Zhejiang, y (MSJ) en Mengshan de la provincia de Guangxi (GX). Usando el índice de diferenciación genética, Fst reveló una diferenciación genética significativa en las poblaciones entre la provincia de Jiangxi (JXGZ) y GX, HY, LH, JD, y Chun"an (CA) de la provincia de Zhejiang, y también reveló una diferenciación genética ligeramente menor para las poblaciones entre HY, LH, JD, GX, provincia de Shaanxi (SX), y Quzhou (QZ) de la provincia de Zhejiang. Además, Fst reveló una gran diferenciación genética entre las poblaciones obtenidas de MSJ y Macf (PTY), y también reveló una débil diferenciación genética entre las poblaciones obtenidas de Osbeck (QC), WG, y BDZ. La prueba de AMOVA mostró que los niveles de diferenciación genética fueron del 19% y 81% entre y dentro de las poblaciones geográficas, respectivamente. También mostró que los niveles de diferenciación genética entre y dentro de las poblaciones huésped fueron del 12% y 88%, respectivamente. La prueba de Mantel mostró que la distancia genética no estaba correlacionada linealmente con la distancia geográfica y el análisis filogenético de haplotipos mostró que las regiones y huéspedes diferentes estaban dispersos en el árbol filogenético, lo que implica que la diferenciación genética era independiente de la variedad de huéspedes y el origen geográfico. Especulamos que la diferenciación genética puede deberse principalmente a mutaciones génicas, recombinación génica o migración génica dentro de las poblaciones nativas y no tiene nada que ver con la selección natural desencadenada por la geografía o la variedad de huéspedes.
Descripción
Para analizar la estructura genética y diversidad genética de la especie dominante en los cítricos, se estudió la diversidad genética de la gliceraldehído-3-fosfato deshidrogenasa (GAPDH), incluyendo 63 cepas aisladas y seleccionadas de 8 sitios diferentes y 5 especies de cítricos diferentes. Un total de 19 haplotipos de GAPDH fueron identificados mediante análisis genético, y el haplotipo principal (haplotipo 5) se distribuyó en 28 aislados, principalmente de Hort. ex Tanaka (WG) y Blanco cv. Succosa (BDZ) en Huangyan (HY), Linhai (LH) y Jiande (JD) de la provincia de Zhejiang, y (MSJ) en Mengshan de la provincia de Guangxi (GX). Usando el índice de diferenciación genética, Fst reveló una diferenciación genética significativa en las poblaciones entre la provincia de Jiangxi (JXGZ) y GX, HY, LH, JD, y Chun"an (CA) de la provincia de Zhejiang, y también reveló una diferenciación genética ligeramente menor para las poblaciones entre HY, LH, JD, GX, provincia de Shaanxi (SX), y Quzhou (QZ) de la provincia de Zhejiang. Además, Fst reveló una gran diferenciación genética entre las poblaciones obtenidas de MSJ y Macf (PTY), y también reveló una débil diferenciación genética entre las poblaciones obtenidas de Osbeck (QC), WG, y BDZ. La prueba de AMOVA mostró que los niveles de diferenciación genética fueron del 19% y 81% entre y dentro de las poblaciones geográficas, respectivamente. También mostró que los niveles de diferenciación genética entre y dentro de las poblaciones huésped fueron del 12% y 88%, respectivamente. La prueba de Mantel mostró que la distancia genética no estaba correlacionada linealmente con la distancia geográfica y el análisis filogenético de haplotipos mostró que las regiones y huéspedes diferentes estaban dispersos en el árbol filogenético, lo que implica que la diferenciación genética era independiente de la variedad de huéspedes y el origen geográfico. Especulamos que la diferenciación genética puede deberse principalmente a mutaciones génicas, recombinación génica o migración génica dentro de las poblaciones nativas y no tiene nada que ver con la selección natural desencadenada por la geografía o la variedad de huéspedes.