Estructura genética y diversidad del nematodo de la raíz del arroz () en Tailandia
Autores: Supajariyapong, Siwakorn; Jørgensen, Hans Jørgen Lyngs; Ruanpanun, Pornthip
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2025
Acceso abierto
Artículo científico
2025
Estructura genética y diversidad del nematodo de la raíz del arroz () en Tailandia
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Agronomía y Ciencia de los Cultivos
Palabras clave
Nematodos de raíz de arroz
Diversidad genética
Tailandia
Campos de arroz
Repeticiones Simples de Secuencia Interna
Variación genética
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 26
Citaciones: Sin citaciones
Los nematodos de la raíz del arroz (spp.) causan graves daños al arroz en varios países productores de arroz en Asia. Sin embargo, hay información limitada sobre la diversidad genética y la estructura de estos nematodos, incluido en Tailandia, donde el estudio actual exploró la diversidad y estructura de spp. de 57 campos de arroz en las principales áreas de cultivo de arroz en todo el país. Utilizando características morfológicas y secuenciación del ADNr del espaciador transcrito interno, identificamos todas las muestras como . El uso de la prueba estadística delta K basada en Inter-Simple-Sequence-Repeats y el análisis de coordenadas principales revelaron dos grupos genéticos diferentes de tres regiones geográficas distintas, incluidas las regiones norte y noreste (Grupo 1) y central (Grupo 2). Mientras que la heterocigosidad esperada no sesgada indicaba una baja diversidad genética en Tailandia (0,149), el índice de información de Shannon indicaba que había una mayor diversidad en el Grupo 2 (0,259) que en el Grupo 1 (0,228). El AMOVA confirmó una alta variación genética dentro de tales grupos (76%), pero una baja variación genética entre los dos grupos (24%). No hubo una correlación clara entre la diversidad genética y la distancia geográfica. Dada la presencia de en casi todos los países productores de arroz, este primer estudio de poblaciones ha proporcionado conocimientos fundamentales que deberían ayudar a combatir esta plaga en el sistema de producción de arroz.
Descripción
Los nematodos de la raíz del arroz (spp.) causan graves daños al arroz en varios países productores de arroz en Asia. Sin embargo, hay información limitada sobre la diversidad genética y la estructura de estos nematodos, incluido en Tailandia, donde el estudio actual exploró la diversidad y estructura de spp. de 57 campos de arroz en las principales áreas de cultivo de arroz en todo el país. Utilizando características morfológicas y secuenciación del ADNr del espaciador transcrito interno, identificamos todas las muestras como . El uso de la prueba estadística delta K basada en Inter-Simple-Sequence-Repeats y el análisis de coordenadas principales revelaron dos grupos genéticos diferentes de tres regiones geográficas distintas, incluidas las regiones norte y noreste (Grupo 1) y central (Grupo 2). Mientras que la heterocigosidad esperada no sesgada indicaba una baja diversidad genética en Tailandia (0,149), el índice de información de Shannon indicaba que había una mayor diversidad en el Grupo 2 (0,259) que en el Grupo 1 (0,228). El AMOVA confirmó una alta variación genética dentro de tales grupos (76%), pero una baja variación genética entre los dos grupos (24%). No hubo una correlación clara entre la diversidad genética y la distancia geográfica. Dada la presencia de en casi todos los países productores de arroz, este primer estudio de poblaciones ha proporcionado conocimientos fundamentales que deberían ayudar a combatir esta plaga en el sistema de producción de arroz.