El estrés térmico (ET) afecta negativamente la salud y la productividad de los animales domésticos, influyendo particularmente en las tasas de implantación embrionaria. Este estudio tiene como objetivo comprender los efectos del estrés térmico en la función endometrial en cabras negras de Hainan durante el período peri-implantación. Recogimos muestras de tejido uterino de cabras de control y sometidas a estrés térmico y realizamos experimentos bajo dos condiciones de temperatura: normal (37 grados C) y estrés térmico (42 grados C), junto con dos tratamientos farmacológicos: cloroquina (CQ) y rapamicina (RAPA). Nuestros resultados indican que el estrés térmico inicialmente suprime la actividad de la autofagia, que aumenta con la exposición prolongada. La modulación de la autofagia a través de estos tratamientos alteró la expresión de los marcadores de receptividad endometrial. Notablemente, la sobreexpresión de una proteína específica revirtió parcialmente la regulación a la baja causada por el estrés térmico. Además, una proteína de unión estrecha se degradó bajo ciertas condiciones, pero se acumuló cuando las células fueron tratadas con CQ. Estos hallazgos sugieren que la autofagia desempeña un papel protector en el mantenimiento de la función endometrial durante el estrés térmico, ofreciendo información que puede ayudar a mejorar los resultados reproductivos en cabras que enfrentan desafíos térmicos.