Dependiendo de las condiciones de su hábitat, las plantas pueden cambiar significativamente la tasa de crecimiento de sus raíces. Sin embargo, los mecanismos de tales respuestas siguen siendo insuficientemente claros. Se estudiaron la influencia de un bajo nivel de iluminación en el contenido de auxinas endógenas, su localización en las hojas y el transporte de los brotes a las raíces, y se relacionaron con la ramificación de raíces laterales de plantas de cebada. Tras una reducción de dos días en la iluminación, se encontró una reducción diez veces mayor en la aparición de raíces laterales. El contenido de auxina (IAA, ácido indol-3-acético) disminuyó en un 84% en las raíces y en un 30% en los brotes, y la inmunolocalización reveló niveles reducidos de IAA en las células del floema de secciones de hojas. El contenido reducido de IAA encontrado en las plantas bajo baja luz sugiere una inhibición de la producción de esta hormona en estas condiciones. Al mismo tiempo, se detectó una regulación a la baja de dos veces de la expresión génica que facilita la entrada de IAA en las células, así como una disminución en la difusión de auxina desde los brotes a través del floema de aproximadamente un 60%. Se sugirió que la reducción en la aparición de raíces laterales en cebada bajo un bajo nivel de iluminación se debía a una alteración del transporte de auxina a través del floema y a la regulación a la baja de los genes responsables del transporte de auxina en las raíces de las plantas. Los resultados confirman la importancia del transporte a larga distancia de auxinas para el control del crecimiento de las raíces en condiciones de baja luz. Se requiere un estudio adicional de los mecanismos que controlan el transporte de auxinas desde los brotes a las raíces en otras especies de plantas.