El amoníaco es un factor principal de calidad del agua que influye en la supervivencia y salud de los camarones, entre los cuales las branquias son el principal órgano efector de la toxicidad por amoníaco. En este estudio, elegimos dos tipos que fueron cultivados en agua de mar a 30 y domesticados en 3 de baja salinidad, respectivamente, y luego se sometieron por separado a estrés por amoníaco durante 14 días en condiciones de agua de mar y de baja salinidad, de los cuales los camarones cultivados en 3 de baja salinidad fueron domesticados a partir de los camarones cultivados en agua de mar a 30 después de 27 días de desalinización gradual de salinidad. En detalle, este estudio incluyó cuatro grupos, a saber, el grupo SC (amoníaco-N 0 mg/L, salinidad 30), grupo SAN (amoníaco-N 10 mg/L, salinidad 30), grupo LC (amoníaco-N 0 mg/L, salinidad 3) y grupo LAN (amoníaco-N 10 mg/L, salinidad 3). El estrés por amoníaco duró 14 días, y luego se exploraron los cambios en la estructura morfológica y la función fisiológica de las branquias. Los resultados muestran que el estrés por amoníaco causó una contracción severa de los filamentos branquiales y la deformación o incluso ruptura de los vasos branquiales. Los indicadores bioquímicos de estrés oxidativo, incluidos los contenidos de LPO y MDA, así como las actividades de T-AOC y GST, aumentaron en los grupos SAN y LAN, mientras que las actividades de CAT y POD y los niveles de expresión de ARNm de genes relacionados con antioxidantes disminuyeron. Además, los niveles de expresión de ARNm de los genes involucrados en el estrés del retículo endoplásmico (y), apoptosis (,, y), desintoxicación (,, y), metabolismo de la glucosa (,, , y) y el ciclo del ácido tricarboxílico (,, , y) disminuyeron en los grupos SAN y LAN; los niveles de genes relacionados con la cadena de transporte de electrones (,, y), y los genes y disminuyeron en el grupo SAN pero aumentaron en el grupo LAN; y el nivel del gen disminuyó pero el gen aumentó en los grupos SAN y LAN. Los niveles de expresión de ARNm de genes relacionados con la regulación osmótica (,, y) disminuyeron en el grupo SAN, mientras que el nivel del gen aumentó en el grupo LAN; el gen disminuyó en ambos grupos. Los resultados demuestran que el estrés por amoníaco podría influir en la homeostasis fisiológica de las branquias de los camarones, posiblemente dañando la morfología del tejido y afectando el redox, la función del retículo endoplásmico, la apoptosis, la desintoxicación, el metabolismo energético y la osmoregulación.