Un método de varianza de flujo a escala diaria (FV), que emplea mediciones de temperatura del aire de baja frecuencia, fue evaluado en comparación con mediciones de covarianza de eddy (EC) de flujos de calor sensible y latente en cuatro sitios que representan ecosistemas de pastizales y cultivos. El flujo de calor sensible se estimó utilizando dos enfoques de FV a escala diaria: M1 (separando datos de día y de noche) y M2 (integrando datos diarios), ambos derivados de formulaciones convencionales. El flujo de calor latente se extrajo como un residuo del cierre del balance energético con el flujo de calor sensible estimado por FV y mediciones adicionales de radiación neta y flujo de calor del suelo. Los resultados mostraron que el método FV tuvo un rendimiento deficiente en la estimación del flujo de calor sensible en los cuatro sitios, principalmente debido a los valores de flujo negativos de los sitios de cultivo. En contraste, la estimación del flujo de calor latente mostró un razonable acuerdo con las mediciones de EC. Notablemente, escalar el método FV de una escala de medio día (M1) a una escala diaria (M2) no mejoró la precisión de las estimaciones de flujos de calor sensible y latente en la mayoría de los sitios. El mejor rendimiento para el flujo de calor latente se logró con M1 en un sitio de cultivo (YF), obteniendo una pendiente de 0.98, un coeficiente de determinación de 0.88 y un error cuadrático medio de 13.13 W m. En general, el método FV a escala diaria, que requiere solo datos de temperatura del aire de baja frecuencia de sistemas de microclima, ofrece un enfoque prometedor para el monitoreo de la evapotranspiración, particularmente en estaciones meteorológicas básicas que carecen de instrumentación de alta frecuencia.