El propósito de este estudio fue estimar la distribución de homocigosis y calcular los coeficientes de endogamia genómica y convencional en tres poblaciones de razas de cerdos genéticamente diversas. Se analizaron los datos genómicos y de pedigrí de Duroc (1586), Landrace (2256) y Yorkshire (3646). Estimamos y comparamos varios coeficientes de endogamia genómica y de pedigrí utilizando diferentes modelos y enfoques. Se identificaron un total de 709,384 segmentos de ROH en Duroc, 816,898 en Landrace y 1,401,781 en Yorkshire, con longitudes promedio de 53.59 Mb, 56.21 Mb y 53.46 Mb, respectivamente. Relativamente, la raza Yorkshire tuvo los segmentos de ROH más cortos, mientras que la raza Landrace tuvo los segmentos de ROH medios más largos. El cromosoma 1 (SSC1) tuvo la mayor cobertura cromosómica por ROH en todas las razas. Entre las razas, se observó una correlación absoluta (1.0) entre F total y F, mostrando que los ROH cortos fueron los principales contribuyentes a los valores generales de F. La asociación general entre la endogamia genómica y convencional fue débil, con valores que oscilaban entre 0.058 y 0.140. En contraste, la endogamia genómica total (F) y las clases de ROH mostraron una fuerte asociación, que oscilaba entre 0.663 y 1.00, entre los genotipos. Los resultados de las estimaciones de endogamia genómica y convencional mejoran nuestra comprensión de la diversidad genética entre los genotipos.