La aplicación superficial de estiércol líquido de ganado lechero (es decir, la difusión) después de la cosecha de alfalfa (L.) es una práctica común. La incorporación de estiércol de baja perturbación (LDMI) puede ofrecer múltiples beneficios, incluida una menor pérdida de amoníaco (NH), gases de efecto invernadero (GHG) y nutrientes hidrológicos en comparación con la difusión. Sin embargo, pocos estudios han cuantificado simultáneamente los impactos de LDMI en el rendimiento de la alfalfa, las emisiones de NH y gases de efecto invernadero (GHG). Medimos las emisiones de NH, óxido nitroso (NO) y metano (CH) para tratamientos de estiércol líquido de ganado lechero aplicados a parcelas de alfalfa para difusión y LDMI durante tres temporadas (2014 a 2016) en el centro de Wisconsin, EE. UU. Hubo diferencias menores en el rendimiento de alfalfa y la absorción de nitrógeno (N) entre los tratamientos y los años. La inyección superficial con disco y el aireador/banda redujeron la pérdida de NH en un 95 y un 52% en comparación con la difusión, respectivamente, sin embargo, ambos aumentaron sustancialmente las emisiones de NO (6 y 4.5 kg/ha año frente a 3.6 kg/ha año para la difusión, respectivamente). La magnitud y el momento de las emisiones de NO estaban relacionados con la aplicación de estiércol y los eventos de precipitación. Las emisiones de CH promedio fueron similares entre los métodos y aumentaron con la humedad del suelo después de la aplicación de estiércol. Los resultados resaltan la importancia de evaluar cuantitativamente los compromisos agroambientales de LDMI frente a la aplicación de estiércol por difusión para las granjas lecheras.