Las neuronas dopaminérgicas en el área tegmental ventral (VTA) y la sustancia negra pars compacta (SNpc) comprenden alrededor del 75% de todas las neuronas dopaminérgicas en el cerebro humano. Aunque ambos grupos de neuronas dopaminérgicas están en estrecha proximidad en el mesencéfalo y se superponen parcialmente, el desarrollo, la función y las alteraciones en estas dos clases de neuronas son altamente diversas. Los mecanismos moleculares y celulares que subyacen a estas diferencias aún no se comprenden completamente, pero la investigación en la última década ha destacado la necesidad de diferenciar entre estas dos clases de neuronas dopaminérgicas durante su desarrollo y en el cerebro maduro. Esta diferenciación es crucial no solo para entender la formación de circuitos fundamentales en el cerebro, sino también para desarrollar terapias dirigidas a clases específicas de neuronas dopaminérgicas sin afectar a otras. En esta revisión, resumimos el estado del arte en nuestra comprensión de las diferencias entre las neuronas dopaminérgicas de la VTA y la SNpc, como la anatomía, estructura, morfología, salida y entrada, electrofisiología, desarrollo y trastornos, y discutimos las tecnologías y métodos actuales disponibles para estudiar estas dos clases de neuronas dopaminérgicas, destacando sus ventajas, limitaciones y las mejoras necesarias para lograr intervenciones terapéuticas más precisas.